Protein–RNA interactions for Protein: P01027

C3, Complement C3, mousemouse

Predictions only

Length 1,663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3P01027 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
C3P01027 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
C3P01027 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
C3P01027 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
C3P01027 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
C3P01027 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
C3P01027 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
C3P01027 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
C3P01027 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
C3P01027 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
C3P01027 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
C3P01027 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
C3P01027 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
C3P01027 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
C3P01027 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
C3P01027 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
C3P01027 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
C3P01027 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
C3P01027 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
C3P01027 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
C3P01027 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
C3P01027 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
C3P01027 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
C3P01027 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
C3P01027 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
C3P01027 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
C3P01027 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
C3P01027 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
C3P01027 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
C3P01027 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
C3P01027 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
C3P01027 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
C3P01027 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
C3P01027 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
C3P01027 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
C3P01027 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
C3P01027 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
C3P01027 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
C3P01027 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
C3P01027 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
C3P01027 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
C3P01027 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
C3P01027 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
C3P01027 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
C3P01027 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
C3P01027 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
C3P01027 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
C3P01027 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
C3P01027 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
C3P01027 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
C3P01027 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
C3P01027 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
C3P01027 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
C3P01027 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
C3P01027 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
C3P01027 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
C3P01027 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
C3P01027 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
C3P01027 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
C3P01027 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
C3P01027 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
C3P01027 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
C3P01027 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
C3P01027 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
C3P01027 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
C3P01027 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
C3P01027 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
C3P01027 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
C3P01027 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
C3P01027 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
C3P01027 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
C3P01027 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
C3P01027 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
C3P01027 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
C3P01027 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
C3P01027 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
C3P01027 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
C3P01027 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
C3P01027 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
C3P01027 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
C3P01027 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
C3P01027 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
C3P01027 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
C3P01027 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
C3P01027 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
C3P01027 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
C3P01027 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
C3P01027 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
C3P01027 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
C3P01027 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
C3P01027 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
C3P01027 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
C3P01027 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
C3P01027 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
C3P01027 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
C3P01027 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
C3P01027 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
C3P01027 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
C3P01027 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
C3P01027 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms