Protein–RNA interactions for Protein: O88990

Actn3, Alpha-actinin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn3O88990 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Actn3O88990 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Actn3O88990 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Actn3O88990 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Actn3O88990 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Actn3O88990 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Actn3O88990 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Actn3O88990 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Actn3O88990 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Actn3O88990 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Actn3O88990 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Actn3O88990 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Actn3O88990 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Actn3O88990 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Actn3O88990 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Actn3O88990 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Actn3O88990 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Actn3O88990 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Actn3O88990 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Actn3O88990 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Actn3O88990 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Actn3O88990 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Actn3O88990 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Actn3O88990 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Actn3O88990 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Actn3O88990 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Actn3O88990 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Actn3O88990 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Actn3O88990 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Actn3O88990 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Actn3O88990 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Actn3O88990 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Actn3O88990 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Actn3O88990 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Actn3O88990 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Actn3O88990 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Actn3O88990 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Actn3O88990 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Actn3O88990 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Actn3O88990 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Actn3O88990 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Actn3O88990 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Actn3O88990 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Actn3O88990 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Actn3O88990 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Actn3O88990 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Actn3O88990 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Actn3O88990 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Actn3O88990 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Actn3O88990 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Actn3O88990 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Actn3O88990 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Actn3O88990 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Actn3O88990 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Actn3O88990 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Actn3O88990 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Actn3O88990 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Actn3O88990 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Actn3O88990 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Actn3O88990 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Actn3O88990 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Actn3O88990 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Actn3O88990 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Actn3O88990 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Actn3O88990 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Actn3O88990 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Actn3O88990 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Actn3O88990 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Actn3O88990 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Actn3O88990 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Actn3O88990 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Actn3O88990 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Actn3O88990 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Actn3O88990 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Actn3O88990 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Actn3O88990 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Actn3O88990 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Actn3O88990 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Actn3O88990 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Actn3O88990 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Actn3O88990 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Actn3O88990 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Actn3O88990 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Actn3O88990 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Actn3O88990 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Actn3O88990 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Actn3O88990 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Actn3O88990 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Actn3O88990 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Actn3O88990 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Actn3O88990 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Actn3O88990 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Actn3O88990 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Actn3O88990 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Actn3O88990 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Actn3O88990 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Actn3O88990 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Actn3O88990 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Actn3O88990 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Actn3O88990 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms