Protein–RNA interactions for Protein: O88632

Sema3f, Semaphorin-3F, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3fO88632 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sema3fO88632 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sema3fO88632 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sema3fO88632 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sema3fO88632 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sema3fO88632 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sema3fO88632 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sema3fO88632 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sema3fO88632 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Sema3fO88632 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sema3fO88632 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sema3fO88632 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sema3fO88632 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Sema3fO88632 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sema3fO88632 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sema3fO88632 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sema3fO88632 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sema3fO88632 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sema3fO88632 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sema3fO88632 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sema3fO88632 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sema3fO88632 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sema3fO88632 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sema3fO88632 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sema3fO88632 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sema3fO88632 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sema3fO88632 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sema3fO88632 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sema3fO88632 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sema3fO88632 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Sema3fO88632 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sema3fO88632 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sema3fO88632 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sema3fO88632 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sema3fO88632 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sema3fO88632 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sema3fO88632 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sema3fO88632 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sema3fO88632 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sema3fO88632 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sema3fO88632 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sema3fO88632 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Sema3fO88632 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sema3fO88632 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sema3fO88632 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sema3fO88632 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sema3fO88632 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Sema3fO88632 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sema3fO88632 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sema3fO88632 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sema3fO88632 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sema3fO88632 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sema3fO88632 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sema3fO88632 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sema3fO88632 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sema3fO88632 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sema3fO88632 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Sema3fO88632 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sema3fO88632 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sema3fO88632 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sema3fO88632 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sema3fO88632 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sema3fO88632 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sema3fO88632 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Sema3fO88632 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sema3fO88632 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sema3fO88632 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sema3fO88632 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sema3fO88632 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sema3fO88632 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sema3fO88632 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sema3fO88632 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sema3fO88632 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sema3fO88632 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sema3fO88632 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sema3fO88632 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Sema3fO88632 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sema3fO88632 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sema3fO88632 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sema3fO88632 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sema3fO88632 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sema3fO88632 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sema3fO88632 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sema3fO88632 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sema3fO88632 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sema3fO88632 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sema3fO88632 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sema3fO88632 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sema3fO88632 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sema3fO88632 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sema3fO88632 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sema3fO88632 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sema3fO88632 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sema3fO88632 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sema3fO88632 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sema3fO88632 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sema3fO88632 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sema3fO88632 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sema3fO88632 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Sema3fO88632 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms