Protein–RNA interactions for Protein: O88543

Cops3, COP9 signalosome complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops3O88543 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cops3O88543 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cops3O88543 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cops3O88543 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cops3O88543 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cops3O88543 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cops3O88543 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cops3O88543 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cops3O88543 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cops3O88543 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cops3O88543 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cops3O88543 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cops3O88543 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cops3O88543 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cops3O88543 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cops3O88543 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cops3O88543 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cops3O88543 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cops3O88543 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cops3O88543 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cops3O88543 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cops3O88543 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cops3O88543 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cops3O88543 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cops3O88543 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cops3O88543 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cops3O88543 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cops3O88543 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cops3O88543 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cops3O88543 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cops3O88543 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cops3O88543 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cops3O88543 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cops3O88543 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cops3O88543 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cops3O88543 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cops3O88543 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cops3O88543 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cops3O88543 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cops3O88543 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cops3O88543 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cops3O88543 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cops3O88543 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cops3O88543 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cops3O88543 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cops3O88543 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cops3O88543 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cops3O88543 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cops3O88543 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cops3O88543 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cops3O88543 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cops3O88543 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cops3O88543 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cops3O88543 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cops3O88543 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cops3O88543 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cops3O88543 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cops3O88543 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cops3O88543 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cops3O88543 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cops3O88543 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cops3O88543 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cops3O88543 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cops3O88543 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cops3O88543 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cops3O88543 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cops3O88543 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cops3O88543 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cops3O88543 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cops3O88543 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cops3O88543 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cops3O88543 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cops3O88543 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cops3O88543 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cops3O88543 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cops3O88543 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cops3O88543 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cops3O88543 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cops3O88543 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cops3O88543 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cops3O88543 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cops3O88543 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cops3O88543 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cops3O88543 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cops3O88543 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cops3O88543 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cops3O88543 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cops3O88543 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cops3O88543 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cops3O88543 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cops3O88543 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cops3O88543 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cops3O88543 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cops3O88543 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cops3O88543 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cops3O88543 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cops3O88543 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cops3O88543 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cops3O88543 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cops3O88543 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms