Protein–RNA interactions for Protein: O88513

Gmnn, Geminin, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GmnnO88513 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GmnnO88513 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GmnnO88513 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GmnnO88513 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GmnnO88513 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GmnnO88513 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GmnnO88513 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GmnnO88513 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GmnnO88513 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GmnnO88513 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GmnnO88513 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GmnnO88513 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GmnnO88513 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GmnnO88513 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GmnnO88513 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GmnnO88513 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GmnnO88513 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GmnnO88513 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GmnnO88513 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GmnnO88513 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GmnnO88513 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GmnnO88513 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GmnnO88513 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GmnnO88513 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GmnnO88513 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GmnnO88513 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GmnnO88513 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GmnnO88513 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GmnnO88513 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GmnnO88513 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GmnnO88513 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GmnnO88513 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GmnnO88513 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GmnnO88513 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GmnnO88513 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GmnnO88513 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
GmnnO88513 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GmnnO88513 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GmnnO88513 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GmnnO88513 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GmnnO88513 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GmnnO88513 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GmnnO88513 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GmnnO88513 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GmnnO88513 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GmnnO88513 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GmnnO88513 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GmnnO88513 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GmnnO88513 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GmnnO88513 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GmnnO88513 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GmnnO88513 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GmnnO88513 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GmnnO88513 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GmnnO88513 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GmnnO88513 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GmnnO88513 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GmnnO88513 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GmnnO88513 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GmnnO88513 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GmnnO88513 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GmnnO88513 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GmnnO88513 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GmnnO88513 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GmnnO88513 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GmnnO88513 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GmnnO88513 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GmnnO88513 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GmnnO88513 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GmnnO88513 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GmnnO88513 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GmnnO88513 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GmnnO88513 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GmnnO88513 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GmnnO88513 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GmnnO88513 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GmnnO88513 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GmnnO88513 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GmnnO88513 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GmnnO88513 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GmnnO88513 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GmnnO88513 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GmnnO88513 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GmnnO88513 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GmnnO88513 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GmnnO88513 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GmnnO88513 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GmnnO88513 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GmnnO88513 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GmnnO88513 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GmnnO88513 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GmnnO88513 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GmnnO88513 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GmnnO88513 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GmnnO88513 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GmnnO88513 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GmnnO88513 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GmnnO88513 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GmnnO88513 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GmnnO88513 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms