Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CntfrO88507 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CntfrO88507 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CntfrO88507 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CntfrO88507 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CntfrO88507 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CntfrO88507 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CntfrO88507 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CntfrO88507 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CntfrO88507 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CntfrO88507 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CntfrO88507 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CntfrO88507 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CntfrO88507 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CntfrO88507 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CntfrO88507 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CntfrO88507 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CntfrO88507 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CntfrO88507 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CntfrO88507 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CntfrO88507 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CntfrO88507 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CntfrO88507 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CntfrO88507 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CntfrO88507 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CntfrO88507 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CntfrO88507 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CntfrO88507 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CntfrO88507 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CntfrO88507 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CntfrO88507 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CntfrO88507 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CntfrO88507 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CntfrO88507 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CntfrO88507 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CntfrO88507 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CntfrO88507 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CntfrO88507 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CntfrO88507 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CntfrO88507 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CntfrO88507 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CntfrO88507 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CntfrO88507 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CntfrO88507 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CntfrO88507 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CntfrO88507 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CntfrO88507 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CntfrO88507 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CntfrO88507 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CntfrO88507 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CntfrO88507 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CntfrO88507 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CntfrO88507 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CntfrO88507 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CntfrO88507 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CntfrO88507 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CntfrO88507 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CntfrO88507 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CntfrO88507 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CntfrO88507 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CntfrO88507 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CntfrO88507 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CntfrO88507 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CntfrO88507 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CntfrO88507 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CntfrO88507 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CntfrO88507 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CntfrO88507 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CntfrO88507 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CntfrO88507 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CntfrO88507 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CntfrO88507 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CntfrO88507 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CntfrO88507 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CntfrO88507 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CntfrO88507 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CntfrO88507 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CntfrO88507 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CntfrO88507 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CntfrO88507 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CntfrO88507 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CntfrO88507 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CntfrO88507 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CntfrO88507 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CntfrO88507 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CntfrO88507 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CntfrO88507 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CntfrO88507 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CntfrO88507 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CntfrO88507 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CntfrO88507 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CntfrO88507 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CntfrO88507 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CntfrO88507 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CntfrO88507 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CntfrO88507 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CntfrO88507 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CntfrO88507 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CntfrO88507 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CntfrO88507 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms