Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itgb5O70309 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itgb5O70309 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itgb5O70309 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itgb5O70309 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itgb5O70309 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itgb5O70309 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Itgb5O70309 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Itgb5O70309 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itgb5O70309 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itgb5O70309 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itgb5O70309 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itgb5O70309 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itgb5O70309 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itgb5O70309 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itgb5O70309 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Itgb5O70309 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itgb5O70309 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itgb5O70309 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itgb5O70309 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Itgb5O70309 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itgb5O70309 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Itgb5O70309 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Itgb5O70309 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Itgb5O70309 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Itgb5O70309 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Itgb5O70309 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Itgb5O70309 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Itgb5O70309 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Itgb5O70309 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Itgb5O70309 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Itgb5O70309 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Itgb5O70309 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Itgb5O70309 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itgb5O70309 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itgb5O70309 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itgb5O70309 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itgb5O70309 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itgb5O70309 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itgb5O70309 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itgb5O70309 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itgb5O70309 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itgb5O70309 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itgb5O70309 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itgb5O70309 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itgb5O70309 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itgb5O70309 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itgb5O70309 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itgb5O70309 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itgb5O70309 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itgb5O70309 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itgb5O70309 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itgb5O70309 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itgb5O70309 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itgb5O70309 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itgb5O70309 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Itgb5O70309 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itgb5O70309 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itgb5O70309 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itgb5O70309 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itgb5O70309 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itgb5O70309 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itgb5O70309 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itgb5O70309 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itgb5O70309 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itgb5O70309 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itgb5O70309 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itgb5O70309 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itgb5O70309 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itgb5O70309 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itgb5O70309 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itgb5O70309 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Itgb5O70309 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Itgb5O70309 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Itgb5O70309 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Itgb5O70309 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Itgb5O70309 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Itgb5O70309 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Itgb5O70309 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Itgb5O70309 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Itgb5O70309 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Itgb5O70309 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Itgb5O70309 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itgb5O70309 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itgb5O70309 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itgb5O70309 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itgb5O70309 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itgb5O70309 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Itgb5O70309 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Itgb5O70309 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itgb5O70309 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itgb5O70309 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itgb5O70309 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itgb5O70309 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itgb5O70309 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Itgb5O70309 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itgb5O70309 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itgb5O70309 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itgb5O70309 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itgb5O70309 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms