Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lnx1O70263 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lnx1O70263 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lnx1O70263 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lnx1O70263 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lnx1O70263 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lnx1O70263 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lnx1O70263 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lnx1O70263 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lnx1O70263 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lnx1O70263 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Lnx1O70263 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lnx1O70263 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lnx1O70263 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lnx1O70263 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Lnx1O70263 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lnx1O70263 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lnx1O70263 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lnx1O70263 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lnx1O70263 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lnx1O70263 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lnx1O70263 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lnx1O70263 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lnx1O70263 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lnx1O70263 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lnx1O70263 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lnx1O70263 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lnx1O70263 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lnx1O70263 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lnx1O70263 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lnx1O70263 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lnx1O70263 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lnx1O70263 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lnx1O70263 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lnx1O70263 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lnx1O70263 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lnx1O70263 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lnx1O70263 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lnx1O70263 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lnx1O70263 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lnx1O70263 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lnx1O70263 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lnx1O70263 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Lnx1O70263 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lnx1O70263 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lnx1O70263 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lnx1O70263 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lnx1O70263 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lnx1O70263 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lnx1O70263 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lnx1O70263 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lnx1O70263 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lnx1O70263 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lnx1O70263 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lnx1O70263 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lnx1O70263 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lnx1O70263 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lnx1O70263 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lnx1O70263 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lnx1O70263 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lnx1O70263 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lnx1O70263 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Lnx1O70263 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lnx1O70263 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lnx1O70263 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Lnx1O70263 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lnx1O70263 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lnx1O70263 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lnx1O70263 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lnx1O70263 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lnx1O70263 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lnx1O70263 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lnx1O70263 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lnx1O70263 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lnx1O70263 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lnx1O70263 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lnx1O70263 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lnx1O70263 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lnx1O70263 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lnx1O70263 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lnx1O70263 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lnx1O70263 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lnx1O70263 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lnx1O70263 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Lnx1O70263 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Lnx1O70263 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Lnx1O70263 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lnx1O70263 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lnx1O70263 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lnx1O70263 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lnx1O70263 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lnx1O70263 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lnx1O70263 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lnx1O70263 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lnx1O70263 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lnx1O70263 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lnx1O70263 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lnx1O70263 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lnx1O70263 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Lnx1O70263 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms