Protein–RNA interactions for Protein: O70194

Eif3d, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3dO70194 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Eif3dO70194 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Eif3dO70194 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Eif3dO70194 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Eif3dO70194 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Eif3dO70194 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Eif3dO70194 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Eif3dO70194 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Eif3dO70194 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Eif3dO70194 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Eif3dO70194 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Eif3dO70194 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Eif3dO70194 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Eif3dO70194 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Eif3dO70194 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Eif3dO70194 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Eif3dO70194 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Eif3dO70194 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Eif3dO70194 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Eif3dO70194 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Eif3dO70194 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Eif3dO70194 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Eif3dO70194 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Eif3dO70194 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Eif3dO70194 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Eif3dO70194 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Eif3dO70194 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Eif3dO70194 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Eif3dO70194 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Eif3dO70194 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Eif3dO70194 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Eif3dO70194 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Eif3dO70194 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Eif3dO70194 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Eif3dO70194 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Eif3dO70194 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Eif3dO70194 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Eif3dO70194 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Eif3dO70194 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Eif3dO70194 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Eif3dO70194 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Eif3dO70194 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Eif3dO70194 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Eif3dO70194 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Eif3dO70194 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Eif3dO70194 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Eif3dO70194 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Eif3dO70194 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Eif3dO70194 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Eif3dO70194 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Eif3dO70194 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Eif3dO70194 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Eif3dO70194 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Eif3dO70194 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Eif3dO70194 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Eif3dO70194 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Eif3dO70194 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Eif3dO70194 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Eif3dO70194 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Eif3dO70194 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Eif3dO70194 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Eif3dO70194 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Eif3dO70194 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Eif3dO70194 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Eif3dO70194 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Eif3dO70194 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Eif3dO70194 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Eif3dO70194 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Eif3dO70194 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Eif3dO70194 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Eif3dO70194 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Eif3dO70194 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Eif3dO70194 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Eif3dO70194 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Eif3dO70194 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Eif3dO70194 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Eif3dO70194 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Eif3dO70194 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Eif3dO70194 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Eif3dO70194 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Eif3dO70194 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Eif3dO70194 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Eif3dO70194 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Eif3dO70194 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Eif3dO70194 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Eif3dO70194 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Eif3dO70194 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Eif3dO70194 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Eif3dO70194 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Eif3dO70194 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Eif3dO70194 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Eif3dO70194 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Eif3dO70194 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Eif3dO70194 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Eif3dO70194 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Eif3dO70194 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Eif3dO70194 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Eif3dO70194 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Eif3dO70194 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Eif3dO70194 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms