Protein–RNA interactions for Protein: O55208

Figla, Factor in the germline alpha, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FiglaO55208 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FiglaO55208 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FiglaO55208 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FiglaO55208 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FiglaO55208 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FiglaO55208 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FiglaO55208 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FiglaO55208 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FiglaO55208 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FiglaO55208 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FiglaO55208 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FiglaO55208 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FiglaO55208 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FiglaO55208 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FiglaO55208 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FiglaO55208 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FiglaO55208 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FiglaO55208 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FiglaO55208 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FiglaO55208 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FiglaO55208 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FiglaO55208 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FiglaO55208 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FiglaO55208 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FiglaO55208 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FiglaO55208 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FiglaO55208 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FiglaO55208 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FiglaO55208 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FiglaO55208 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FiglaO55208 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FiglaO55208 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
FiglaO55208 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FiglaO55208 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FiglaO55208 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FiglaO55208 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FiglaO55208 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FiglaO55208 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FiglaO55208 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FiglaO55208 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FiglaO55208 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FiglaO55208 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FiglaO55208 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
FiglaO55208 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FiglaO55208 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FiglaO55208 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FiglaO55208 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
FiglaO55208 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FiglaO55208 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FiglaO55208 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FiglaO55208 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FiglaO55208 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FiglaO55208 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FiglaO55208 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FiglaO55208 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FiglaO55208 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FiglaO55208 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FiglaO55208 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FiglaO55208 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FiglaO55208 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FiglaO55208 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FiglaO55208 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FiglaO55208 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FiglaO55208 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FiglaO55208 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FiglaO55208 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FiglaO55208 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FiglaO55208 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FiglaO55208 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FiglaO55208 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FiglaO55208 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FiglaO55208 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FiglaO55208 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FiglaO55208 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FiglaO55208 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FiglaO55208 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FiglaO55208 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FiglaO55208 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FiglaO55208 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FiglaO55208 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FiglaO55208 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FiglaO55208 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FiglaO55208 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FiglaO55208 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FiglaO55208 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FiglaO55208 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FiglaO55208 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FiglaO55208 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FiglaO55208 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FiglaO55208 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FiglaO55208 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FiglaO55208 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FiglaO55208 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FiglaO55208 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FiglaO55208 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FiglaO55208 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FiglaO55208 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FiglaO55208 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FiglaO55208 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
FiglaO55208 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms