Protein–RNA interactions for Protein: O55142

Rpl35a, 60S ribosomal protein L35a, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35aO55142 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl35aO55142 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl35aO55142 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl35aO55142 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl35aO55142 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl35aO55142 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rpl35aO55142 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl35aO55142 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl35aO55142 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl35aO55142 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl35aO55142 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl35aO55142 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rpl35aO55142 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl35aO55142 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl35aO55142 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl35aO55142 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl35aO55142 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl35aO55142 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl35aO55142 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl35aO55142 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl35aO55142 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl35aO55142 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl35aO55142 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl35aO55142 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl35aO55142 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl35aO55142 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rpl35aO55142 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl35aO55142 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl35aO55142 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl35aO55142 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl35aO55142 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl35aO55142 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl35aO55142 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl35aO55142 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl35aO55142 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl35aO55142 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl35aO55142 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl35aO55142 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl35aO55142 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rpl35aO55142 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl35aO55142 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl35aO55142 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl35aO55142 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl35aO55142 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl35aO55142 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rpl35aO55142 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl35aO55142 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl35aO55142 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl35aO55142 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl35aO55142 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl35aO55142 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl35aO55142 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl35aO55142 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl35aO55142 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl35aO55142 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl35aO55142 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rpl35aO55142 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl35aO55142 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl35aO55142 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl35aO55142 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl35aO55142 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl35aO55142 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl35aO55142 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl35aO55142 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl35aO55142 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpl35aO55142 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpl35aO55142 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpl35aO55142 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpl35aO55142 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpl35aO55142 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Rpl35aO55142 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rpl35aO55142 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rpl35aO55142 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rpl35aO55142 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpl35aO55142 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpl35aO55142 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpl35aO55142 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rpl35aO55142 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rpl35aO55142 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rpl35aO55142 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rpl35aO55142 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rpl35aO55142 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rpl35aO55142 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rpl35aO55142 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl35aO55142 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl35aO55142 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl35aO55142 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl35aO55142 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl35aO55142 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl35aO55142 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl35aO55142 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl35aO55142 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl35aO55142 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl35aO55142 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl35aO55142 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl35aO55142 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl35aO55142 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl35aO55142 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl35aO55142 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl35aO55142 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms