Protein–RNA interactions for Protein: O55123

Mmp10, Stromelysin-2, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp10O55123 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mmp10O55123 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mmp10O55123 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mmp10O55123 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mmp10O55123 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Mmp10O55123 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mmp10O55123 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mmp10O55123 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mmp10O55123 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Mmp10O55123 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Mmp10O55123 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Mmp10O55123 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mmp10O55123 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Mmp10O55123 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mmp10O55123 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mmp10O55123 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mmp10O55123 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mmp10O55123 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mmp10O55123 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mmp10O55123 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mmp10O55123 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mmp10O55123 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mmp10O55123 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Mmp10O55123 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mmp10O55123 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mmp10O55123 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Mmp10O55123 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Mmp10O55123 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Mmp10O55123 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mmp10O55123 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mmp10O55123 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mmp10O55123 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mmp10O55123 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mmp10O55123 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mmp10O55123 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mmp10O55123 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mmp10O55123 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mmp10O55123 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mmp10O55123 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mmp10O55123 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mmp10O55123 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mmp10O55123 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Mmp10O55123 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Mmp10O55123 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mmp10O55123 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mmp10O55123 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mmp10O55123 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mmp10O55123 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mmp10O55123 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mmp10O55123 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mmp10O55123 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mmp10O55123 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mmp10O55123 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mmp10O55123 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mmp10O55123 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Mmp10O55123 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mmp10O55123 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mmp10O55123 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mmp10O55123 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mmp10O55123 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mmp10O55123 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mmp10O55123 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mmp10O55123 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Mmp10O55123 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mmp10O55123 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mmp10O55123 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mmp10O55123 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mmp10O55123 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mmp10O55123 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mmp10O55123 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mmp10O55123 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mmp10O55123 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mmp10O55123 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mmp10O55123 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mmp10O55123 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mmp10O55123 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mmp10O55123 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mmp10O55123 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mmp10O55123 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mmp10O55123 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mmp10O55123 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mmp10O55123 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mmp10O55123 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Mmp10O55123 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mmp10O55123 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mmp10O55123 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mmp10O55123 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mmp10O55123 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mmp10O55123 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mmp10O55123 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mmp10O55123 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mmp10O55123 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mmp10O55123 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mmp10O55123 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mmp10O55123 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mmp10O55123 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mmp10O55123 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mmp10O55123 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mmp10O55123 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mmp10O55123 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.7 ms