Protein–RNA interactions for Protein: O55103

Prx, Periaxin, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrxO55103 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PrxO55103 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PrxO55103 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PrxO55103 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PrxO55103 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PrxO55103 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PrxO55103 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PrxO55103 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PrxO55103 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PrxO55103 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PrxO55103 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PrxO55103 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PrxO55103 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PrxO55103 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PrxO55103 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PrxO55103 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PrxO55103 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PrxO55103 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PrxO55103 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PrxO55103 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PrxO55103 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PrxO55103 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PrxO55103 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PrxO55103 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PrxO55103 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PrxO55103 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PrxO55103 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PrxO55103 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PrxO55103 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PrxO55103 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PrxO55103 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PrxO55103 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PrxO55103 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PrxO55103 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PrxO55103 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PrxO55103 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PrxO55103 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PrxO55103 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PrxO55103 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PrxO55103 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PrxO55103 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PrxO55103 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PrxO55103 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PrxO55103 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PrxO55103 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PrxO55103 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PrxO55103 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PrxO55103 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PrxO55103 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PrxO55103 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PrxO55103 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PrxO55103 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PrxO55103 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PrxO55103 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PrxO55103 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PrxO55103 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PrxO55103 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PrxO55103 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PrxO55103 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PrxO55103 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PrxO55103 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PrxO55103 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PrxO55103 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PrxO55103 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PrxO55103 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PrxO55103 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PrxO55103 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PrxO55103 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PrxO55103 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PrxO55103 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PrxO55103 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PrxO55103 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PrxO55103 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PrxO55103 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PrxO55103 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PrxO55103 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PrxO55103 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PrxO55103 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PrxO55103 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PrxO55103 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PrxO55103 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PrxO55103 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PrxO55103 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PrxO55103 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PrxO55103 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PrxO55103 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PrxO55103 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PrxO55103 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PrxO55103 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PrxO55103 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PrxO55103 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PrxO55103 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PrxO55103 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PrxO55103 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PrxO55103 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PrxO55103 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PrxO55103 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PrxO55103 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PrxO55103 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PrxO55103 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms