Protein–RNA interactions for Protein: O54946

Dnajb6, DnaJ homolog subfamily B member 6, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajb6O54946 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Dnajb6O54946 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Dnajb6O54946 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Dnajb6O54946 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Dnajb6O54946 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dnajb6O54946 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dnajb6O54946 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dnajb6O54946 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dnajb6O54946 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dnajb6O54946 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dnajb6O54946 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Dnajb6O54946 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dnajb6O54946 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dnajb6O54946 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dnajb6O54946 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dnajb6O54946 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dnajb6O54946 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dnajb6O54946 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dnajb6O54946 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dnajb6O54946 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dnajb6O54946 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dnajb6O54946 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dnajb6O54946 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dnajb6O54946 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dnajb6O54946 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dnajb6O54946 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dnajb6O54946 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dnajb6O54946 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dnajb6O54946 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dnajb6O54946 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dnajb6O54946 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dnajb6O54946 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dnajb6O54946 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dnajb6O54946 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dnajb6O54946 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dnajb6O54946 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dnajb6O54946 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dnajb6O54946 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dnajb6O54946 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dnajb6O54946 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dnajb6O54946 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dnajb6O54946 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dnajb6O54946 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Dnajb6O54946 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dnajb6O54946 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dnajb6O54946 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dnajb6O54946 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dnajb6O54946 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dnajb6O54946 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dnajb6O54946 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dnajb6O54946 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dnajb6O54946 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dnajb6O54946 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dnajb6O54946 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dnajb6O54946 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dnajb6O54946 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dnajb6O54946 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dnajb6O54946 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dnajb6O54946 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dnajb6O54946 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dnajb6O54946 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Dnajb6O54946 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dnajb6O54946 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Dnajb6O54946 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dnajb6O54946 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dnajb6O54946 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Dnajb6O54946 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dnajb6O54946 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dnajb6O54946 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dnajb6O54946 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dnajb6O54946 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dnajb6O54946 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Dnajb6O54946 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dnajb6O54946 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dnajb6O54946 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dnajb6O54946 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dnajb6O54946 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dnajb6O54946 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dnajb6O54946 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Dnajb6O54946 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Dnajb6O54946 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dnajb6O54946 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dnajb6O54946 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dnajb6O54946 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dnajb6O54946 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dnajb6O54946 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dnajb6O54946 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dnajb6O54946 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dnajb6O54946 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dnajb6O54946 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dnajb6O54946 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Dnajb6O54946 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dnajb6O54946 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dnajb6O54946 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dnajb6O54946 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dnajb6O54946 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dnajb6O54946 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Dnajb6O54946 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dnajb6O54946 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dnajb6O54946 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms