Protein–RNA interactions for Protein: O54941

Smarce1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarce1O54941 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smarce1O54941 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smarce1O54941 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smarce1O54941 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smarce1O54941 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smarce1O54941 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smarce1O54941 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smarce1O54941 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smarce1O54941 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smarce1O54941 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smarce1O54941 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smarce1O54941 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Smarce1O54941 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smarce1O54941 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smarce1O54941 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smarce1O54941 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smarce1O54941 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smarce1O54941 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smarce1O54941 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smarce1O54941 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smarce1O54941 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smarce1O54941 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Smarce1O54941 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smarce1O54941 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smarce1O54941 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smarce1O54941 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smarce1O54941 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smarce1O54941 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smarce1O54941 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smarce1O54941 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smarce1O54941 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smarce1O54941 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smarce1O54941 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smarce1O54941 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smarce1O54941 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Smarce1O54941 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Smarce1O54941 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smarce1O54941 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smarce1O54941 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smarce1O54941 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smarce1O54941 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smarce1O54941 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smarce1O54941 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smarce1O54941 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smarce1O54941 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smarce1O54941 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smarce1O54941 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smarce1O54941 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smarce1O54941 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smarce1O54941 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smarce1O54941 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smarce1O54941 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smarce1O54941 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smarce1O54941 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smarce1O54941 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smarce1O54941 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smarce1O54941 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smarce1O54941 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smarce1O54941 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smarce1O54941 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smarce1O54941 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Smarce1O54941 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smarce1O54941 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smarce1O54941 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smarce1O54941 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smarce1O54941 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smarce1O54941 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smarce1O54941 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smarce1O54941 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smarce1O54941 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smarce1O54941 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smarce1O54941 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Smarce1O54941 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smarce1O54941 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smarce1O54941 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smarce1O54941 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smarce1O54941 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smarce1O54941 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smarce1O54941 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smarce1O54941 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smarce1O54941 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smarce1O54941 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Smarce1O54941 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smarce1O54941 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smarce1O54941 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smarce1O54941 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smarce1O54941 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smarce1O54941 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smarce1O54941 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smarce1O54941 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smarce1O54941 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smarce1O54941 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smarce1O54941 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smarce1O54941 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smarce1O54941 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Smarce1O54941 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Smarce1O54941 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smarce1O54941 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Smarce1O54941 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smarce1O54941 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms