Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itgb3O54890 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Itgb3O54890 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itgb3O54890 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itgb3O54890 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itgb3O54890 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itgb3O54890 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itgb3O54890 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itgb3O54890 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itgb3O54890 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itgb3O54890 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itgb3O54890 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itgb3O54890 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itgb3O54890 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itgb3O54890 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itgb3O54890 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itgb3O54890 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itgb3O54890 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itgb3O54890 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itgb3O54890 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itgb3O54890 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Itgb3O54890 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itgb3O54890 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Itgb3O54890 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itgb3O54890 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itgb3O54890 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itgb3O54890 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itgb3O54890 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itgb3O54890 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Itgb3O54890 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itgb3O54890 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itgb3O54890 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Itgb3O54890 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itgb3O54890 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itgb3O54890 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itgb3O54890 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Itgb3O54890 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itgb3O54890 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itgb3O54890 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itgb3O54890 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itgb3O54890 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itgb3O54890 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itgb3O54890 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itgb3O54890 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itgb3O54890 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itgb3O54890 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itgb3O54890 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itgb3O54890 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itgb3O54890 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itgb3O54890 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itgb3O54890 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itgb3O54890 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itgb3O54890 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itgb3O54890 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itgb3O54890 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itgb3O54890 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itgb3O54890 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Itgb3O54890 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itgb3O54890 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itgb3O54890 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itgb3O54890 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itgb3O54890 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itgb3O54890 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itgb3O54890 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itgb3O54890 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itgb3O54890 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itgb3O54890 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itgb3O54890 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itgb3O54890 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itgb3O54890 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itgb3O54890 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itgb3O54890 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itgb3O54890 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itgb3O54890 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itgb3O54890 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itgb3O54890 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itgb3O54890 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itgb3O54890 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Itgb3O54890 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itgb3O54890 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itgb3O54890 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itgb3O54890 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itgb3O54890 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itgb3O54890 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itgb3O54890 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itgb3O54890 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itgb3O54890 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Itgb3O54890 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itgb3O54890 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Itgb3O54890 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itgb3O54890 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itgb3O54890 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itgb3O54890 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itgb3O54890 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itgb3O54890 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itgb3O54890 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itgb3O54890 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itgb3O54890 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itgb3O54890 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itgb3O54890 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms