Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DffaO54786 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DffaO54786 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DffaO54786 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DffaO54786 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
DffaO54786 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DffaO54786 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DffaO54786 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DffaO54786 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DffaO54786 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DffaO54786 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DffaO54786 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DffaO54786 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DffaO54786 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DffaO54786 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DffaO54786 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DffaO54786 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DffaO54786 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DffaO54786 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DffaO54786 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DffaO54786 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DffaO54786 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DffaO54786 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DffaO54786 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DffaO54786 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DffaO54786 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DffaO54786 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DffaO54786 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
DffaO54786 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DffaO54786 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DffaO54786 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DffaO54786 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DffaO54786 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DffaO54786 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DffaO54786 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DffaO54786 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DffaO54786 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DffaO54786 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DffaO54786 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DffaO54786 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
DffaO54786 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
DffaO54786 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DffaO54786 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DffaO54786 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DffaO54786 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DffaO54786 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DffaO54786 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DffaO54786 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DffaO54786 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DffaO54786 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DffaO54786 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DffaO54786 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DffaO54786 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DffaO54786 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DffaO54786 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DffaO54786 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DffaO54786 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DffaO54786 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DffaO54786 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DffaO54786 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DffaO54786 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
DffaO54786 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DffaO54786 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DffaO54786 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DffaO54786 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
DffaO54786 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DffaO54786 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DffaO54786 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DffaO54786 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DffaO54786 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DffaO54786 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DffaO54786 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DffaO54786 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DffaO54786 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DffaO54786 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
DffaO54786 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DffaO54786 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DffaO54786 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DffaO54786 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DffaO54786 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DffaO54786 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DffaO54786 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DffaO54786 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DffaO54786 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DffaO54786 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DffaO54786 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DffaO54786 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DffaO54786 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DffaO54786 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DffaO54786 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DffaO54786 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DffaO54786 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DffaO54786 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DffaO54786 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DffaO54786 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DffaO54786 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DffaO54786 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DffaO54786 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DffaO54786 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DffaO54786 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms