Protein–RNA interactions for Protein: O35714

Tnfrsf18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf18O35714 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnfrsf18O35714 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnfrsf18O35714 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnfrsf18O35714 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnfrsf18O35714 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnfrsf18O35714 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnfrsf18O35714 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnfrsf18O35714 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnfrsf18O35714 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnfrsf18O35714 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnfrsf18O35714 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnfrsf18O35714 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnfrsf18O35714 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tnfrsf18O35714 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tnfrsf18O35714 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tnfrsf18O35714 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnfrsf18O35714 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnfrsf18O35714 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnfrsf18O35714 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnfrsf18O35714 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnfrsf18O35714 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnfrsf18O35714 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnfrsf18O35714 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnfrsf18O35714 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnfrsf18O35714 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnfrsf18O35714 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnfrsf18O35714 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnfrsf18O35714 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnfrsf18O35714 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnfrsf18O35714 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnfrsf18O35714 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnfrsf18O35714 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnfrsf18O35714 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnfrsf18O35714 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnfrsf18O35714 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnfrsf18O35714 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnfrsf18O35714 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnfrsf18O35714 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnfrsf18O35714 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnfrsf18O35714 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnfrsf18O35714 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnfrsf18O35714 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnfrsf18O35714 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnfrsf18O35714 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnfrsf18O35714 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnfrsf18O35714 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnfrsf18O35714 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnfrsf18O35714 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnfrsf18O35714 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnfrsf18O35714 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnfrsf18O35714 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnfrsf18O35714 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnfrsf18O35714 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnfrsf18O35714 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnfrsf18O35714 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnfrsf18O35714 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnfrsf18O35714 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnfrsf18O35714 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnfrsf18O35714 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnfrsf18O35714 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnfrsf18O35714 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnfrsf18O35714 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnfrsf18O35714 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tnfrsf18O35714 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnfrsf18O35714 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnfrsf18O35714 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnfrsf18O35714 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnfrsf18O35714 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnfrsf18O35714 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnfrsf18O35714 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnfrsf18O35714 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnfrsf18O35714 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnfrsf18O35714 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnfrsf18O35714 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnfrsf18O35714 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnfrsf18O35714 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnfrsf18O35714 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnfrsf18O35714 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnfrsf18O35714 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnfrsf18O35714 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnfrsf18O35714 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnfrsf18O35714 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnfrsf18O35714 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnfrsf18O35714 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnfrsf18O35714 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnfrsf18O35714 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnfrsf18O35714 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnfrsf18O35714 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnfrsf18O35714 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnfrsf18O35714 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnfrsf18O35714 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnfrsf18O35714 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnfrsf18O35714 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnfrsf18O35714 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnfrsf18O35714 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnfrsf18O35714 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnfrsf18O35714 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnfrsf18O35714 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnfrsf18O35714 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnfrsf18O35714 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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