Protein–RNA interactions for Protein: O35685

Nudc, Nuclear migration protein nudC, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NudcO35685 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NudcO35685 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NudcO35685 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NudcO35685 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NudcO35685 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NudcO35685 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
NudcO35685 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NudcO35685 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NudcO35685 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NudcO35685 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NudcO35685 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NudcO35685 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NudcO35685 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NudcO35685 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
NudcO35685 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NudcO35685 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NudcO35685 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NudcO35685 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NudcO35685 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NudcO35685 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NudcO35685 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NudcO35685 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NudcO35685 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NudcO35685 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NudcO35685 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
NudcO35685 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NudcO35685 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NudcO35685 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NudcO35685 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NudcO35685 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NudcO35685 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NudcO35685 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NudcO35685 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NudcO35685 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NudcO35685 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NudcO35685 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NudcO35685 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NudcO35685 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NudcO35685 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NudcO35685 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NudcO35685 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NudcO35685 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NudcO35685 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NudcO35685 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NudcO35685 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NudcO35685 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NudcO35685 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NudcO35685 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NudcO35685 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NudcO35685 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
NudcO35685 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NudcO35685 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NudcO35685 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NudcO35685 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NudcO35685 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NudcO35685 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NudcO35685 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NudcO35685 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NudcO35685 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NudcO35685 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NudcO35685 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NudcO35685 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NudcO35685 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NudcO35685 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NudcO35685 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NudcO35685 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NudcO35685 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NudcO35685 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NudcO35685 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NudcO35685 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NudcO35685 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NudcO35685 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
NudcO35685 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NudcO35685 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
NudcO35685 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NudcO35685 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NudcO35685 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NudcO35685 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NudcO35685 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NudcO35685 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NudcO35685 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NudcO35685 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NudcO35685 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NudcO35685 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NudcO35685 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NudcO35685 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NudcO35685 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NudcO35685 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NudcO35685 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NudcO35685 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NudcO35685 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NudcO35685 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NudcO35685 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NudcO35685 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NudcO35685 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NudcO35685 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NudcO35685 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NudcO35685 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NudcO35685 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NudcO35685 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms