Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clk2O35491 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clk2O35491 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clk2O35491 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clk2O35491 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clk2O35491 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clk2O35491 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clk2O35491 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clk2O35491 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clk2O35491 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clk2O35491 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clk2O35491 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clk2O35491 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clk2O35491 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clk2O35491 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clk2O35491 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clk2O35491 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clk2O35491 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clk2O35491 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clk2O35491 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clk2O35491 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clk2O35491 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clk2O35491 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Clk2O35491 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clk2O35491 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clk2O35491 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Clk2O35491 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clk2O35491 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clk2O35491 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Clk2O35491 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clk2O35491 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clk2O35491 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clk2O35491 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clk2O35491 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clk2O35491 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clk2O35491 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clk2O35491 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clk2O35491 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clk2O35491 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clk2O35491 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clk2O35491 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clk2O35491 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clk2O35491 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clk2O35491 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Clk2O35491 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clk2O35491 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clk2O35491 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clk2O35491 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clk2O35491 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clk2O35491 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Clk2O35491 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clk2O35491 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clk2O35491 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clk2O35491 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clk2O35491 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clk2O35491 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clk2O35491 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clk2O35491 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clk2O35491 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clk2O35491 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Clk2O35491 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clk2O35491 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clk2O35491 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clk2O35491 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clk2O35491 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clk2O35491 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Clk2O35491 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clk2O35491 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clk2O35491 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clk2O35491 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clk2O35491 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clk2O35491 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clk2O35491 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clk2O35491 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Clk2O35491 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clk2O35491 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clk2O35491 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clk2O35491 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clk2O35491 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clk2O35491 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Clk2O35491 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clk2O35491 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clk2O35491 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clk2O35491 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clk2O35491 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Clk2O35491 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clk2O35491 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clk2O35491 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clk2O35491 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Clk2O35491 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Clk2O35491 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Clk2O35491 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clk2O35491 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Clk2O35491 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clk2O35491 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clk2O35491 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clk2O35491 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clk2O35491 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clk2O35491 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clk2O35491 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms