Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Edil3O35474 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Edil3O35474 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Edil3O35474 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Edil3O35474 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Edil3O35474 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Edil3O35474 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Edil3O35474 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Edil3O35474 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Edil3O35474 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Edil3O35474 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Edil3O35474 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Edil3O35474 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Edil3O35474 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Edil3O35474 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Edil3O35474 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Edil3O35474 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Edil3O35474 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Edil3O35474 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Edil3O35474 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Edil3O35474 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Edil3O35474 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Edil3O35474 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Edil3O35474 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Edil3O35474 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Edil3O35474 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Edil3O35474 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Edil3O35474 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Edil3O35474 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Edil3O35474 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Edil3O35474 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Edil3O35474 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Edil3O35474 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Edil3O35474 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Edil3O35474 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Edil3O35474 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Edil3O35474 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Edil3O35474 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Edil3O35474 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Edil3O35474 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Edil3O35474 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Edil3O35474 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Edil3O35474 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Edil3O35474 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Edil3O35474 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Edil3O35474 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Edil3O35474 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Edil3O35474 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Edil3O35474 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Edil3O35474 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Edil3O35474 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Edil3O35474 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Edil3O35474 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Edil3O35474 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Edil3O35474 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Edil3O35474 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Edil3O35474 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Edil3O35474 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Edil3O35474 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Edil3O35474 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Edil3O35474 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Edil3O35474 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Edil3O35474 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Edil3O35474 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Edil3O35474 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Edil3O35474 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Edil3O35474 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Edil3O35474 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Edil3O35474 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Edil3O35474 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Edil3O35474 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Edil3O35474 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Edil3O35474 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Edil3O35474 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Edil3O35474 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Edil3O35474 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Edil3O35474 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Edil3O35474 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Edil3O35474 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Edil3O35474 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Edil3O35474 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Edil3O35474 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Edil3O35474 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Edil3O35474 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Edil3O35474 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Edil3O35474 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Edil3O35474 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Edil3O35474 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Edil3O35474 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Edil3O35474 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Edil3O35474 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Edil3O35474 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Edil3O35474 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Edil3O35474 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Edil3O35474 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Edil3O35474 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Edil3O35474 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Edil3O35474 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Edil3O35474 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Edil3O35474 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms