Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kpna3O35344 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kpna3O35344 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kpna3O35344 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kpna3O35344 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kpna3O35344 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kpna3O35344 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kpna3O35344 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kpna3O35344 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kpna3O35344 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kpna3O35344 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kpna3O35344 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kpna3O35344 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kpna3O35344 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kpna3O35344 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kpna3O35344 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kpna3O35344 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kpna3O35344 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kpna3O35344 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kpna3O35344 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kpna3O35344 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kpna3O35344 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kpna3O35344 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kpna3O35344 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kpna3O35344 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Kpna3O35344 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kpna3O35344 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kpna3O35344 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kpna3O35344 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kpna3O35344 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kpna3O35344 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kpna3O35344 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Kpna3O35344 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Kpna3O35344 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Kpna3O35344 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Kpna3O35344 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Kpna3O35344 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kpna3O35344 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Kpna3O35344 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kpna3O35344 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kpna3O35344 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kpna3O35344 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kpna3O35344 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Kpna3O35344 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kpna3O35344 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kpna3O35344 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kpna3O35344 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kpna3O35344 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kpna3O35344 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kpna3O35344 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kpna3O35344 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kpna3O35344 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kpna3O35344 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kpna3O35344 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kpna3O35344 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kpna3O35344 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kpna3O35344 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kpna3O35344 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Kpna3O35344 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kpna3O35344 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kpna3O35344 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Kpna3O35344 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kpna3O35344 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kpna3O35344 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kpna3O35344 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kpna3O35344 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kpna3O35344 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kpna3O35344 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kpna3O35344 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kpna3O35344 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kpna3O35344 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Kpna3O35344 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kpna3O35344 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kpna3O35344 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kpna3O35344 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kpna3O35344 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kpna3O35344 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kpna3O35344 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kpna3O35344 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kpna3O35344 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kpna3O35344 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kpna3O35344 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kpna3O35344 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kpna3O35344 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kpna3O35344 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kpna3O35344 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kpna3O35344 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kpna3O35344 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kpna3O35344 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kpna3O35344 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kpna3O35344 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kpna3O35344 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kpna3O35344 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kpna3O35344 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kpna3O35344 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kpna3O35344 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kpna3O35344 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kpna3O35344 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kpna3O35344 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kpna3O35344 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms