Protein–RNA interactions for Protein: O35305

Tnfrsf11a, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 11A, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf11aO35305 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnfrsf11aO35305 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnfrsf11aO35305 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnfrsf11aO35305 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnfrsf11aO35305 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnfrsf11aO35305 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnfrsf11aO35305 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnfrsf11aO35305 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnfrsf11aO35305 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnfrsf11aO35305 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnfrsf11aO35305 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnfrsf11aO35305 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnfrsf11aO35305 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnfrsf11aO35305 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnfrsf11aO35305 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Tnfrsf11aO35305 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tnfrsf11aO35305 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnfrsf11aO35305 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnfrsf11aO35305 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnfrsf11aO35305 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnfrsf11aO35305 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnfrsf11aO35305 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnfrsf11aO35305 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnfrsf11aO35305 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnfrsf11aO35305 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnfrsf11aO35305 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnfrsf11aO35305 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnfrsf11aO35305 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnfrsf11aO35305 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnfrsf11aO35305 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnfrsf11aO35305 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnfrsf11aO35305 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnfrsf11aO35305 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnfrsf11aO35305 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnfrsf11aO35305 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnfrsf11aO35305 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnfrsf11aO35305 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnfrsf11aO35305 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnfrsf11aO35305 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnfrsf11aO35305 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnfrsf11aO35305 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnfrsf11aO35305 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnfrsf11aO35305 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnfrsf11aO35305 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnfrsf11aO35305 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnfrsf11aO35305 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnfrsf11aO35305 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnfrsf11aO35305 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnfrsf11aO35305 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnfrsf11aO35305 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnfrsf11aO35305 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnfrsf11aO35305 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnfrsf11aO35305 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnfrsf11aO35305 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnfrsf11aO35305 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnfrsf11aO35305 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnfrsf11aO35305 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnfrsf11aO35305 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnfrsf11aO35305 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnfrsf11aO35305 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnfrsf11aO35305 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnfrsf11aO35305 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnfrsf11aO35305 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnfrsf11aO35305 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnfrsf11aO35305 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnfrsf11aO35305 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnfrsf11aO35305 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnfrsf11aO35305 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnfrsf11aO35305 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnfrsf11aO35305 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnfrsf11aO35305 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnfrsf11aO35305 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnfrsf11aO35305 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnfrsf11aO35305 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnfrsf11aO35305 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnfrsf11aO35305 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnfrsf11aO35305 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnfrsf11aO35305 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnfrsf11aO35305 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnfrsf11aO35305 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnfrsf11aO35305 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnfrsf11aO35305 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnfrsf11aO35305 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnfrsf11aO35305 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnfrsf11aO35305 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnfrsf11aO35305 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnfrsf11aO35305 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnfrsf11aO35305 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnfrsf11aO35305 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnfrsf11aO35305 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnfrsf11aO35305 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnfrsf11aO35305 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnfrsf11aO35305 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnfrsf11aO35305 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnfrsf11aO35305 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnfrsf11aO35305 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnfrsf11aO35305 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnfrsf11aO35305 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnfrsf11aO35305 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnfrsf11aO35305 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms