Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bhlhe40O35185 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bhlhe40O35185 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bhlhe40O35185 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bhlhe40O35185 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Bhlhe40O35185 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bhlhe40O35185 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bhlhe40O35185 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Bhlhe40O35185 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bhlhe40O35185 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bhlhe40O35185 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Bhlhe40O35185 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Bhlhe40O35185 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Bhlhe40O35185 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bhlhe40O35185 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bhlhe40O35185 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bhlhe40O35185 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bhlhe40O35185 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bhlhe40O35185 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bhlhe40O35185 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bhlhe40O35185 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Bhlhe40O35185 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bhlhe40O35185 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bhlhe40O35185 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bhlhe40O35185 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bhlhe40O35185 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bhlhe40O35185 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Bhlhe40O35185 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Bhlhe40O35185 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Bhlhe40O35185 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Bhlhe40O35185 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Bhlhe40O35185 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Bhlhe40O35185 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Bhlhe40O35185 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Bhlhe40O35185 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Bhlhe40O35185 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Bhlhe40O35185 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Bhlhe40O35185 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Bhlhe40O35185 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Bhlhe40O35185 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Bhlhe40O35185 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Bhlhe40O35185 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Bhlhe40O35185 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Bhlhe40O35185 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bhlhe40O35185 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bhlhe40O35185 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bhlhe40O35185 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Bhlhe40O35185 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bhlhe40O35185 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bhlhe40O35185 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Bhlhe40O35185 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Bhlhe40O35185 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Bhlhe40O35185 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Bhlhe40O35185 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Bhlhe40O35185 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Bhlhe40O35185 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Bhlhe40O35185 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Bhlhe40O35185 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bhlhe40O35185 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bhlhe40O35185 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bhlhe40O35185 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bhlhe40O35185 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bhlhe40O35185 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bhlhe40O35185 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bhlhe40O35185 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bhlhe40O35185 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bhlhe40O35185 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bhlhe40O35185 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Bhlhe40O35185 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bhlhe40O35185 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bhlhe40O35185 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bhlhe40O35185 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bhlhe40O35185 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bhlhe40O35185 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bhlhe40O35185 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Bhlhe40O35185 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bhlhe40O35185 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bhlhe40O35185 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bhlhe40O35185 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bhlhe40O35185 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bhlhe40O35185 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bhlhe40O35185 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Bhlhe40O35185 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Bhlhe40O35185 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Bhlhe40O35185 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Bhlhe40O35185 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Bhlhe40O35185 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Bhlhe40O35185 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Bhlhe40O35185 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Bhlhe40O35185 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Bhlhe40O35185 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Bhlhe40O35185 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Bhlhe40O35185 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Bhlhe40O35185 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Bhlhe40O35185 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bhlhe40O35185 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bhlhe40O35185 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bhlhe40O35185 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bhlhe40O35185 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bhlhe40O35185 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms