Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Polr1aO35134 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Polr1aO35134 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Polr1aO35134 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Polr1aO35134 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Polr1aO35134 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Polr1aO35134 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Polr1aO35134 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Polr1aO35134 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Polr1aO35134 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Polr1aO35134 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Polr1aO35134 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Polr1aO35134 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Polr1aO35134 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Polr1aO35134 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Polr1aO35134 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Polr1aO35134 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Polr1aO35134 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Polr1aO35134 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC32■■■□□ 2.71
Polr1aO35134 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
Polr1aO35134 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Polr1aO35134 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Polr1aO35134 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Polr1aO35134 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Polr1aO35134 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Polr1aO35134 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
Polr1aO35134 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
Polr1aO35134 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Polr1aO35134 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Polr1aO35134 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Polr1aO35134 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Polr1aO35134 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Polr1aO35134 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Polr1aO35134 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Polr1aO35134 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Polr1aO35134 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.7
Polr1aO35134 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.7
Polr1aO35134 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Polr1aO35134 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC31.95■■■□□ 2.7
Polr1aO35134 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC31.95■■■□□ 2.7
Polr1aO35134 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Polr1aO35134 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Polr1aO35134 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Polr1aO35134 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Polr1aO35134 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Polr1aO35134 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Polr1aO35134 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Polr1aO35134 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Polr1aO35134 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Polr1aO35134 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Polr1aO35134 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Polr1aO35134 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Polr1aO35134 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Polr1aO35134 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Polr1aO35134 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Polr1aO35134 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Polr1aO35134 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
Polr1aO35134 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Polr1aO35134 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Polr1aO35134 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Polr1aO35134 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Polr1aO35134 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
Polr1aO35134 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Polr1aO35134 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Polr1aO35134 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Polr1aO35134 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Polr1aO35134 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Polr1aO35134 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Polr1aO35134 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Polr1aO35134 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Polr1aO35134 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Polr1aO35134 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Polr1aO35134 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Polr1aO35134 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Polr1aO35134 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Polr1aO35134 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Polr1aO35134 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Polr1aO35134 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Polr1aO35134 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Polr1aO35134 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Polr1aO35134 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Polr1aO35134 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Polr1aO35134 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Polr1aO35134 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Polr1aO35134 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Polr1aO35134 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Polr1aO35134 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Polr1aO35134 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Polr1aO35134 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Polr1aO35134 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
Polr1aO35134 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Polr1aO35134 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Polr1aO35134 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Polr1aO35134 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Polr1aO35134 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Polr1aO35134 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Polr1aO35134 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Polr1aO35134 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Polr1aO35134 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Polr1aO35134 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms