Protein–RNA interactions for Protein: O08999

Ltbp2, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,813 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltbp2O08999 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ltbp2O08999 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ltbp2O08999 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ltbp2O08999 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ltbp2O08999 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ltbp2O08999 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ltbp2O08999 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ltbp2O08999 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ltbp2O08999 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ltbp2O08999 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ltbp2O08999 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ltbp2O08999 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ltbp2O08999 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ltbp2O08999 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ltbp2O08999 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ltbp2O08999 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ltbp2O08999 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ltbp2O08999 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ltbp2O08999 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ltbp2O08999 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ltbp2O08999 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ltbp2O08999 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ltbp2O08999 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ltbp2O08999 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ltbp2O08999 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ltbp2O08999 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ltbp2O08999 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ltbp2O08999 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ltbp2O08999 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ltbp2O08999 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ltbp2O08999 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ltbp2O08999 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ltbp2O08999 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ltbp2O08999 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ltbp2O08999 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ltbp2O08999 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ltbp2O08999 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ltbp2O08999 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ltbp2O08999 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ltbp2O08999 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ltbp2O08999 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ltbp2O08999 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ltbp2O08999 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ltbp2O08999 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ltbp2O08999 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ltbp2O08999 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ltbp2O08999 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ltbp2O08999 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ltbp2O08999 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ltbp2O08999 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ltbp2O08999 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ltbp2O08999 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ltbp2O08999 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ltbp2O08999 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ltbp2O08999 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ltbp2O08999 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ltbp2O08999 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ltbp2O08999 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ltbp2O08999 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ltbp2O08999 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ltbp2O08999 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ltbp2O08999 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ltbp2O08999 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ltbp2O08999 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ltbp2O08999 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ltbp2O08999 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ltbp2O08999 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ltbp2O08999 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ltbp2O08999 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ltbp2O08999 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ltbp2O08999 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ltbp2O08999 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ltbp2O08999 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ltbp2O08999 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ltbp2O08999 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ltbp2O08999 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ltbp2O08999 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ltbp2O08999 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ltbp2O08999 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ltbp2O08999 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ltbp2O08999 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ltbp2O08999 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ltbp2O08999 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ltbp2O08999 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ltbp2O08999 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ltbp2O08999 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ltbp2O08999 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ltbp2O08999 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ltbp2O08999 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ltbp2O08999 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ltbp2O08999 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ltbp2O08999 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ltbp2O08999 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ltbp2O08999 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ltbp2O08999 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ltbp2O08999 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ltbp2O08999 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ltbp2O08999 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ltbp2O08999 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ltbp2O08999 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms