Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sec22bO08547 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sec22bO08547 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sec22bO08547 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sec22bO08547 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sec22bO08547 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sec22bO08547 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sec22bO08547 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sec22bO08547 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sec22bO08547 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sec22bO08547 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sec22bO08547 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sec22bO08547 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sec22bO08547 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sec22bO08547 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sec22bO08547 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sec22bO08547 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sec22bO08547 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sec22bO08547 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sec22bO08547 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sec22bO08547 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sec22bO08547 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sec22bO08547 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sec22bO08547 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sec22bO08547 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sec22bO08547 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sec22bO08547 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sec22bO08547 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sec22bO08547 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sec22bO08547 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sec22bO08547 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sec22bO08547 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sec22bO08547 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sec22bO08547 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sec22bO08547 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sec22bO08547 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sec22bO08547 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sec22bO08547 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sec22bO08547 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sec22bO08547 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sec22bO08547 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sec22bO08547 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sec22bO08547 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sec22bO08547 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sec22bO08547 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sec22bO08547 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sec22bO08547 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sec22bO08547 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sec22bO08547 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sec22bO08547 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sec22bO08547 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sec22bO08547 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sec22bO08547 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sec22bO08547 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sec22bO08547 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sec22bO08547 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sec22bO08547 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sec22bO08547 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sec22bO08547 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sec22bO08547 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sec22bO08547 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Sec22bO08547 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Sec22bO08547 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Sec22bO08547 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sec22bO08547 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sec22bO08547 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sec22bO08547 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sec22bO08547 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sec22bO08547 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sec22bO08547 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sec22bO08547 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sec22bO08547 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sec22bO08547 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sec22bO08547 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Sec22bO08547 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sec22bO08547 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sec22bO08547 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sec22bO08547 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sec22bO08547 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sec22bO08547 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sec22bO08547 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sec22bO08547 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sec22bO08547 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sec22bO08547 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sec22bO08547 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sec22bO08547 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sec22bO08547 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sec22bO08547 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sec22bO08547 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sec22bO08547 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sec22bO08547 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sec22bO08547 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sec22bO08547 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Sec22bO08547 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sec22bO08547 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sec22bO08547 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sec22bO08547 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sec22bO08547 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sec22bO08547 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sec22bO08547 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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