Protein–RNA interactions for Protein: O08543

Efna5, Ephrin-A5, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna5O08543 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Efna5O08543 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Efna5O08543 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Efna5O08543 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Efna5O08543 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Efna5O08543 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Efna5O08543 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Efna5O08543 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Efna5O08543 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Efna5O08543 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Efna5O08543 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Efna5O08543 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Efna5O08543 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Efna5O08543 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Efna5O08543 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Efna5O08543 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Efna5O08543 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Efna5O08543 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Efna5O08543 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Efna5O08543 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Efna5O08543 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Efna5O08543 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Efna5O08543 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Efna5O08543 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Efna5O08543 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Efna5O08543 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Efna5O08543 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Efna5O08543 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Efna5O08543 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Efna5O08543 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Efna5O08543 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Efna5O08543 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Efna5O08543 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Efna5O08543 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Efna5O08543 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Efna5O08543 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Efna5O08543 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Efna5O08543 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Efna5O08543 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Efna5O08543 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Efna5O08543 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Efna5O08543 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Efna5O08543 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Efna5O08543 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Efna5O08543 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Efna5O08543 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Efna5O08543 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Efna5O08543 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Efna5O08543 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Efna5O08543 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Efna5O08543 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Efna5O08543 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Efna5O08543 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Efna5O08543 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Efna5O08543 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Efna5O08543 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Efna5O08543 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Efna5O08543 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Efna5O08543 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Efna5O08543 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Efna5O08543 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Efna5O08543 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Efna5O08543 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Efna5O08543 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Efna5O08543 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Efna5O08543 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Efna5O08543 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Efna5O08543 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Efna5O08543 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Efna5O08543 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Efna5O08543 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Efna5O08543 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Efna5O08543 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Efna5O08543 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Efna5O08543 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Efna5O08543 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Efna5O08543 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Efna5O08543 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Efna5O08543 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Efna5O08543 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Efna5O08543 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Efna5O08543 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Efna5O08543 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Efna5O08543 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Efna5O08543 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Efna5O08543 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Efna5O08543 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Efna5O08543 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Efna5O08543 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Efna5O08543 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Efna5O08543 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Efna5O08543 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Efna5O08543 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Efna5O08543 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Efna5O08543 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Efna5O08543 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Efna5O08543 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Efna5O08543 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Efna5O08543 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Efna5O08543 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms