Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D2

Gm3278, Predicted gene 3278, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3278L7N2D2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm3278L7N2D2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm3278L7N2D2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm3278L7N2D2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm3278L7N2D2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm3278L7N2D2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm3278L7N2D2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm3278L7N2D2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm3278L7N2D2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm3278L7N2D2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm3278L7N2D2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm3278L7N2D2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm3278L7N2D2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm3278L7N2D2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm3278L7N2D2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm3278L7N2D2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm3278L7N2D2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm3278L7N2D2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm3278L7N2D2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm3278L7N2D2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm3278L7N2D2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm3278L7N2D2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm3278L7N2D2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm3278L7N2D2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm3278L7N2D2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm3278L7N2D2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm3278L7N2D2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm3278L7N2D2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm3278L7N2D2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm3278L7N2D2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm3278L7N2D2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm3278L7N2D2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm3278L7N2D2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm3278L7N2D2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm3278L7N2D2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm3278L7N2D2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm3278L7N2D2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm3278L7N2D2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm3278L7N2D2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm3278L7N2D2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm3278L7N2D2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gm3278L7N2D2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gm3278L7N2D2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm3278L7N2D2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm3278L7N2D2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm3278L7N2D2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm3278L7N2D2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm3278L7N2D2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm3278L7N2D2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm3278L7N2D2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm3278L7N2D2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm3278L7N2D2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm3278L7N2D2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm3278L7N2D2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm3278L7N2D2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm3278L7N2D2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm3278L7N2D2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm3278L7N2D2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm3278L7N2D2 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm3278L7N2D2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm3278L7N2D2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm3278L7N2D2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm3278L7N2D2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm3278L7N2D2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm3278L7N2D2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm3278L7N2D2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm3278L7N2D2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm3278L7N2D2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm3278L7N2D2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm3278L7N2D2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm3278L7N2D2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm3278L7N2D2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm3278L7N2D2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm3278L7N2D2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm3278L7N2D2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm3278L7N2D2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm3278L7N2D2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm3278L7N2D2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm3278L7N2D2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm3278L7N2D2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm3278L7N2D2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gm3278L7N2D2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gm3278L7N2D2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm3278L7N2D2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm3278L7N2D2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm3278L7N2D2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm3278L7N2D2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm3278L7N2D2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm3278L7N2D2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm3278L7N2D2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm3278L7N2D2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm3278L7N2D2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm3278L7N2D2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm3278L7N2D2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm3278L7N2D2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm3278L7N2D2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm3278L7N2D2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm3278L7N2D2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm3278L7N2D2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm3278L7N2D2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms