Protein–RNA interactions for Protein: L7N1Z3

Vmn1r80, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r80L7N1Z3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r80L7N1Z3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r80L7N1Z3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r80L7N1Z3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r80L7N1Z3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r80L7N1Z3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r80L7N1Z3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r80L7N1Z3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r80L7N1Z3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r80L7N1Z3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r80L7N1Z3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r80L7N1Z3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r80L7N1Z3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r80L7N1Z3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r80L7N1Z3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r80L7N1Z3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r80L7N1Z3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r80L7N1Z3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r80L7N1Z3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r80L7N1Z3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r80L7N1Z3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r80L7N1Z3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r80L7N1Z3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r80L7N1Z3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r80L7N1Z3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r80L7N1Z3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r80L7N1Z3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r80L7N1Z3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r80L7N1Z3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r80L7N1Z3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r80L7N1Z3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r80L7N1Z3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r80L7N1Z3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r80L7N1Z3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r80L7N1Z3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r80L7N1Z3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r80L7N1Z3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r80L7N1Z3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r80L7N1Z3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r80L7N1Z3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r80L7N1Z3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r80L7N1Z3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Vmn1r80L7N1Z3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Vmn1r80L7N1Z3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r80L7N1Z3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r80L7N1Z3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r80L7N1Z3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r80L7N1Z3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r80L7N1Z3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r80L7N1Z3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r80L7N1Z3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r80L7N1Z3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r80L7N1Z3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r80L7N1Z3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r80L7N1Z3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r80L7N1Z3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r80L7N1Z3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r80L7N1Z3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r80L7N1Z3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r80L7N1Z3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r80L7N1Z3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r80L7N1Z3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r80L7N1Z3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r80L7N1Z3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r80L7N1Z3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r80L7N1Z3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r80L7N1Z3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r80L7N1Z3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r80L7N1Z3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r80L7N1Z3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r80L7N1Z3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r80L7N1Z3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r80L7N1Z3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r80L7N1Z3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r80L7N1Z3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r80L7N1Z3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r80L7N1Z3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r80L7N1Z3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r80L7N1Z3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r80L7N1Z3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r80L7N1Z3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r80L7N1Z3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r80L7N1Z3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r80L7N1Z3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r80L7N1Z3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r80L7N1Z3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r80L7N1Z3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r80L7N1Z3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r80L7N1Z3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r80L7N1Z3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r80L7N1Z3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r80L7N1Z3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r80L7N1Z3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r80L7N1Z3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Vmn1r80L7N1Z3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vmn1r80L7N1Z3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vmn1r80L7N1Z3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vmn1r80L7N1Z3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r80L7N1Z3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r80L7N1Z3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms