Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ27

Ccdc191, Coiled-coil domain-containing 191, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc191J3QQ27 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc191J3QQ27 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc191J3QQ27 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc191J3QQ27 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc191J3QQ27 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc191J3QQ27 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc191J3QQ27 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc191J3QQ27 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc191J3QQ27 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc191J3QQ27 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc191J3QQ27 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc191J3QQ27 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc191J3QQ27 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc191J3QQ27 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc191J3QQ27 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc191J3QQ27 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc191J3QQ27 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc191J3QQ27 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc191J3QQ27 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc191J3QQ27 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc191J3QQ27 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc191J3QQ27 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc191J3QQ27 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc191J3QQ27 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc191J3QQ27 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc191J3QQ27 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc191J3QQ27 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc191J3QQ27 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc191J3QQ27 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc191J3QQ27 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc191J3QQ27 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc191J3QQ27 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc191J3QQ27 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc191J3QQ27 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc191J3QQ27 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc191J3QQ27 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc191J3QQ27 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc191J3QQ27 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc191J3QQ27 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc191J3QQ27 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc191J3QQ27 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc191J3QQ27 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc191J3QQ27 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc191J3QQ27 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc191J3QQ27 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc191J3QQ27 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc191J3QQ27 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc191J3QQ27 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc191J3QQ27 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc191J3QQ27 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc191J3QQ27 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc191J3QQ27 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc191J3QQ27 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc191J3QQ27 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc191J3QQ27 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc191J3QQ27 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc191J3QQ27 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc191J3QQ27 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc191J3QQ27 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc191J3QQ27 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc191J3QQ27 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc191J3QQ27 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc191J3QQ27 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc191J3QQ27 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc191J3QQ27 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc191J3QQ27 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc191J3QQ27 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc191J3QQ27 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc191J3QQ27 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc191J3QQ27 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc191J3QQ27 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc191J3QQ27 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc191J3QQ27 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc191J3QQ27 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc191J3QQ27 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc191J3QQ27 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc191J3QQ27 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc191J3QQ27 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc191J3QQ27 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc191J3QQ27 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc191J3QQ27 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc191J3QQ27 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc191J3QQ27 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc191J3QQ27 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc191J3QQ27 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc191J3QQ27 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc191J3QQ27 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc191J3QQ27 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc191J3QQ27 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc191J3QQ27 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc191J3QQ27 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc191J3QQ27 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc191J3QQ27 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc191J3QQ27 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc191J3QQ27 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc191J3QQ27 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccdc191J3QQ27 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc191J3QQ27 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc191J3QQ27 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc191J3QQ27 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms