Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ23

Gm21310, Predicted gene, 21310, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21310J3QQ23 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Gm21310J3QQ23 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21310J3QQ23 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21310J3QQ23 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21310J3QQ23 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21310J3QQ23 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21310J3QQ23 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21310J3QQ23 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21310J3QQ23 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21310J3QQ23 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21310J3QQ23 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21310J3QQ23 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21310J3QQ23 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21310J3QQ23 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21310J3QQ23 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21310J3QQ23 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21310J3QQ23 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21310J3QQ23 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21310J3QQ23 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21310J3QQ23 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21310J3QQ23 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21310J3QQ23 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21310J3QQ23 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21310J3QQ23 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21310J3QQ23 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21310J3QQ23 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21310J3QQ23 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21310J3QQ23 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21310J3QQ23 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21310J3QQ23 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21310J3QQ23 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21310J3QQ23 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21310J3QQ23 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21310J3QQ23 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21310J3QQ23 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21310J3QQ23 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Gm21310J3QQ23 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21310J3QQ23 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21310J3QQ23 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Gm21310J3QQ23 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21310J3QQ23 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21310J3QQ23 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm21310J3QQ23 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm21310J3QQ23 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm21310J3QQ23 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm21310J3QQ23 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21310J3QQ23 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21310J3QQ23 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Gm21310J3QQ23 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21310J3QQ23 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21310J3QQ23 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21310J3QQ23 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21310J3QQ23 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Gm21310J3QQ23 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Gm21310J3QQ23 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Gm21310J3QQ23 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21310J3QQ23 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21310J3QQ23 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21310J3QQ23 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gm21310J3QQ23 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gm21310J3QQ23 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm21310J3QQ23 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm21310J3QQ23 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm21310J3QQ23 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm21310J3QQ23 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm21310J3QQ23 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm21310J3QQ23 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm21310J3QQ23 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm21310J3QQ23 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm21310J3QQ23 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm21310J3QQ23 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm21310J3QQ23 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm21310J3QQ23 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm21310J3QQ23 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21310J3QQ23 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21310J3QQ23 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21310J3QQ23 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21310J3QQ23 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21310J3QQ23 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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