Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ccer2J3QPU5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ccer2J3QPU5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ccer2J3QPU5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ccer2J3QPU5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ccer2J3QPU5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ccer2J3QPU5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ccer2J3QPU5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ccer2J3QPU5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ccer2J3QPU5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ccer2J3QPU5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ccer2J3QPU5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ccer2J3QPU5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ccer2J3QPU5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ccer2J3QPU5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ccer2J3QPU5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Ccer2J3QPU5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ccer2J3QPU5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ccer2J3QPU5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ccer2J3QPU5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ccer2J3QPU5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ccer2J3QPU5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ccer2J3QPU5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ccer2J3QPU5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ccer2J3QPU5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ccer2J3QPU5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ccer2J3QPU5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ccer2J3QPU5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ccer2J3QPU5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Ccer2J3QPU5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ccer2J3QPU5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ccer2J3QPU5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ccer2J3QPU5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ccer2J3QPU5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ccer2J3QPU5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ccer2J3QPU5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ccer2J3QPU5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ccer2J3QPU5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ccer2J3QPU5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Ccer2J3QPU5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ccer2J3QPU5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ccer2J3QPU5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ccer2J3QPU5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Ccer2J3QPU5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ccer2J3QPU5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ccer2J3QPU5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ccer2J3QPU5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ccer2J3QPU5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ccer2J3QPU5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ccer2J3QPU5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ccer2J3QPU5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ccer2J3QPU5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ccer2J3QPU5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ccer2J3QPU5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ccer2J3QPU5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ccer2J3QPU5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ccer2J3QPU5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ccer2J3QPU5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ccer2J3QPU5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ccer2J3QPU5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ccer2J3QPU5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ccer2J3QPU5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ccer2J3QPU5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ccer2J3QPU5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ccer2J3QPU5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Ccer2J3QPU5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ccer2J3QPU5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ccer2J3QPU5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ccer2J3QPU5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ccer2J3QPU5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ccer2J3QPU5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ccer2J3QPU5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ccer2J3QPU5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ccer2J3QPU5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ccer2J3QPU5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ccer2J3QPU5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ccer2J3QPU5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ccer2J3QPU5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ccer2J3QPU5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ccer2J3QPU5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ccer2J3QPU5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ccer2J3QPU5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ccer2J3QPU5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ccer2J3QPU5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ccer2J3QPU5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ccer2J3QPU5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ccer2J3QPU5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ccer2J3QPU5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ccer2J3QPU5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ccer2J3QPU5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ccer2J3QPU5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ccer2J3QPU5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ccer2J3QPU5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ccer2J3QPU5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ccer2J3QPU5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ccer2J3QPU5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ccer2J3QPU5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ccer2J3QPU5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ccer2J3QPU5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ccer2J3QPU5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms