Protein–RNA interactions for Protein: J3QNU5

Gm21798, Predicted gene, 21798, mousemouse

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21798J3QNU5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21798J3QNU5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21798J3QNU5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21798J3QNU5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21798J3QNU5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21798J3QNU5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21798J3QNU5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21798J3QNU5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21798J3QNU5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21798J3QNU5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21798J3QNU5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21798J3QNU5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21798J3QNU5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21798J3QNU5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21798J3QNU5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Gm21798J3QNU5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21798J3QNU5 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21798J3QNU5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21798J3QNU5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21798J3QNU5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21798J3QNU5 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21798J3QNU5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21798J3QNU5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21798J3QNU5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21798J3QNU5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21798J3QNU5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21798J3QNU5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21798J3QNU5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21798J3QNU5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21798J3QNU5 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21798J3QNU5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21798J3QNU5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21798J3QNU5 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21798J3QNU5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21798J3QNU5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21798J3QNU5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21798J3QNU5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Gm21798J3QNU5 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21798J3QNU5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21798J3QNU5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21798J3QNU5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21798J3QNU5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21798J3QNU5 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21798J3QNU5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21798J3QNU5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21798J3QNU5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Gm21798J3QNU5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21798J3QNU5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21798J3QNU5 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21798J3QNU5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21798J3QNU5 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21798J3QNU5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21798J3QNU5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21798J3QNU5 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Gm21798J3QNU5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21798J3QNU5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21798J3QNU5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21798J3QNU5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21798J3QNU5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21798J3QNU5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Gm21798J3QNU5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Gm21798J3QNU5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21798J3QNU5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21798J3QNU5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21798J3QNU5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21798J3QNU5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21798J3QNU5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21798J3QNU5 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21798J3QNU5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21798J3QNU5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21798J3QNU5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21798J3QNU5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21798J3QNU5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21798J3QNU5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21798J3QNU5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21798J3QNU5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21798J3QNU5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21798J3QNU5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21798J3QNU5 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21798J3QNU5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21798J3QNU5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21798J3QNU5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21798J3QNU5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21798J3QNU5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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