Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smim18J3QNP2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smim18J3QNP2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smim18J3QNP2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Smim18J3QNP2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smim18J3QNP2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Smim18J3QNP2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smim18J3QNP2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smim18J3QNP2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Smim18J3QNP2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Smim18J3QNP2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Smim18J3QNP2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smim18J3QNP2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smim18J3QNP2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smim18J3QNP2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smim18J3QNP2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smim18J3QNP2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smim18J3QNP2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smim18J3QNP2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Smim18J3QNP2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smim18J3QNP2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smim18J3QNP2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smim18J3QNP2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smim18J3QNP2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smim18J3QNP2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smim18J3QNP2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smim18J3QNP2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smim18J3QNP2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smim18J3QNP2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smim18J3QNP2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Smim18J3QNP2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smim18J3QNP2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smim18J3QNP2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smim18J3QNP2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smim18J3QNP2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smim18J3QNP2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smim18J3QNP2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smim18J3QNP2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smim18J3QNP2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smim18J3QNP2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smim18J3QNP2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Smim18J3QNP2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smim18J3QNP2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smim18J3QNP2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smim18J3QNP2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smim18J3QNP2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smim18J3QNP2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smim18J3QNP2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smim18J3QNP2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smim18J3QNP2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smim18J3QNP2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smim18J3QNP2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smim18J3QNP2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smim18J3QNP2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smim18J3QNP2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smim18J3QNP2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smim18J3QNP2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smim18J3QNP2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smim18J3QNP2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smim18J3QNP2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smim18J3QNP2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smim18J3QNP2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smim18J3QNP2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smim18J3QNP2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smim18J3QNP2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smim18J3QNP2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smim18J3QNP2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smim18J3QNP2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smim18J3QNP2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smim18J3QNP2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smim18J3QNP2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smim18J3QNP2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smim18J3QNP2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smim18J3QNP2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smim18J3QNP2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smim18J3QNP2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smim18J3QNP2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smim18J3QNP2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smim18J3QNP2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smim18J3QNP2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smim18J3QNP2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smim18J3QNP2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Smim18J3QNP2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Smim18J3QNP2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Smim18J3QNP2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Smim18J3QNP2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Smim18J3QNP2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Smim18J3QNP2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smim18J3QNP2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smim18J3QNP2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smim18J3QNP2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smim18J3QNP2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smim18J3QNP2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smim18J3QNP2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smim18J3QNP2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smim18J3QNP2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smim18J3QNP2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smim18J3QNP2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smim18J3QNP2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smim18J3QNP2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms