Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU2

Gm21820, Predicted gene, 21820, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21820J3KMU2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm21820J3KMU2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm21820J3KMU2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm21820J3KMU2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm21820J3KMU2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm21820J3KMU2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm21820J3KMU2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm21820J3KMU2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm21820J3KMU2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm21820J3KMU2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm21820J3KMU2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm21820J3KMU2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm21820J3KMU2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm21820J3KMU2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm21820J3KMU2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm21820J3KMU2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm21820J3KMU2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm21820J3KMU2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm21820J3KMU2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm21820J3KMU2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm21820J3KMU2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm21820J3KMU2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm21820J3KMU2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm21820J3KMU2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm21820J3KMU2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm21820J3KMU2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm21820J3KMU2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm21820J3KMU2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm21820J3KMU2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm21820J3KMU2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm21820J3KMU2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm21820J3KMU2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm21820J3KMU2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm21820J3KMU2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm21820J3KMU2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm21820J3KMU2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm21820J3KMU2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm21820J3KMU2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm21820J3KMU2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm21820J3KMU2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm21820J3KMU2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm21820J3KMU2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm21820J3KMU2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm21820J3KMU2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm21820J3KMU2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm21820J3KMU2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm21820J3KMU2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm21820J3KMU2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm21820J3KMU2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm21820J3KMU2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm21820J3KMU2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm21820J3KMU2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm21820J3KMU2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm21820J3KMU2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm21820J3KMU2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm21820J3KMU2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm21820J3KMU2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm21820J3KMU2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm21820J3KMU2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm21820J3KMU2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm21820J3KMU2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm21820J3KMU2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm21820J3KMU2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm21820J3KMU2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm21820J3KMU2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm21820J3KMU2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm21820J3KMU2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm21820J3KMU2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm21820J3KMU2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm21820J3KMU2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm21820J3KMU2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm21820J3KMU2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm21820J3KMU2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm21820J3KMU2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm21820J3KMU2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm21820J3KMU2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm21820J3KMU2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm21820J3KMU2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm21820J3KMU2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm21820J3KMU2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm21820J3KMU2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm21820J3KMU2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm21820J3KMU2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm21820J3KMU2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm21820J3KMU2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm21820J3KMU2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm21820J3KMU2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm21820J3KMU2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm21820J3KMU2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm21820J3KMU2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm21820J3KMU2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm21820J3KMU2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm21820J3KMU2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm21820J3KMU2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm21820J3KMU2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm21820J3KMU2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm21820J3KMU2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm21820J3KMU2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm21820J3KMU2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm21820J3KMU2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
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