Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Taf4bG5E8Z2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Taf4bG5E8Z2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Taf4bG5E8Z2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Taf4bG5E8Z2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Taf4bG5E8Z2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Taf4bG5E8Z2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Taf4bG5E8Z2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Taf4bG5E8Z2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Taf4bG5E8Z2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Taf4bG5E8Z2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Taf4bG5E8Z2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Taf4bG5E8Z2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Taf4bG5E8Z2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Taf4bG5E8Z2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Taf4bG5E8Z2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Taf4bG5E8Z2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Taf4bG5E8Z2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Taf4bG5E8Z2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Taf4bG5E8Z2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Taf4bG5E8Z2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Taf4bG5E8Z2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Taf4bG5E8Z2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Taf4bG5E8Z2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Taf4bG5E8Z2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Taf4bG5E8Z2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Taf4bG5E8Z2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Taf4bG5E8Z2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Taf4bG5E8Z2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Taf4bG5E8Z2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Taf4bG5E8Z2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Taf4bG5E8Z2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Taf4bG5E8Z2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Taf4bG5E8Z2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Taf4bG5E8Z2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Taf4bG5E8Z2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Taf4bG5E8Z2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Taf4bG5E8Z2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Taf4bG5E8Z2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Taf4bG5E8Z2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Taf4bG5E8Z2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Taf4bG5E8Z2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Taf4bG5E8Z2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Taf4bG5E8Z2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Taf4bG5E8Z2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Taf4bG5E8Z2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Taf4bG5E8Z2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Taf4bG5E8Z2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Taf4bG5E8Z2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Taf4bG5E8Z2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Taf4bG5E8Z2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Taf4bG5E8Z2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Taf4bG5E8Z2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Taf4bG5E8Z2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Taf4bG5E8Z2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Taf4bG5E8Z2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Taf4bG5E8Z2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Taf4bG5E8Z2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Taf4bG5E8Z2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Taf4bG5E8Z2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Taf4bG5E8Z2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Taf4bG5E8Z2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Taf4bG5E8Z2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Taf4bG5E8Z2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Taf4bG5E8Z2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Taf4bG5E8Z2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Taf4bG5E8Z2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Taf4bG5E8Z2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Taf4bG5E8Z2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Taf4bG5E8Z2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Taf4bG5E8Z2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Taf4bG5E8Z2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Taf4bG5E8Z2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Taf4bG5E8Z2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Taf4bG5E8Z2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Taf4bG5E8Z2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Taf4bG5E8Z2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Taf4bG5E8Z2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Taf4bG5E8Z2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Taf4bG5E8Z2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Taf4bG5E8Z2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Taf4bG5E8Z2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Taf4bG5E8Z2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Taf4bG5E8Z2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Taf4bG5E8Z2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Taf4bG5E8Z2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Taf4bG5E8Z2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Taf4bG5E8Z2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Taf4bG5E8Z2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Taf4bG5E8Z2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Taf4bG5E8Z2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Taf4bG5E8Z2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Taf4bG5E8Z2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Taf4bG5E8Z2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Taf4bG5E8Z2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Taf4bG5E8Z2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Taf4bG5E8Z2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Taf4bG5E8Z2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Taf4bG5E8Z2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Taf4bG5E8Z2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 173 ms