Protein–RNA interactions for Protein: G5E8I7

Usp17lc, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein C, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lcG5E8I7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp17lcG5E8I7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp17lcG5E8I7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp17lcG5E8I7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp17lcG5E8I7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp17lcG5E8I7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp17lcG5E8I7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp17lcG5E8I7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp17lcG5E8I7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp17lcG5E8I7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp17lcG5E8I7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp17lcG5E8I7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp17lcG5E8I7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp17lcG5E8I7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp17lcG5E8I7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp17lcG5E8I7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp17lcG5E8I7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp17lcG5E8I7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp17lcG5E8I7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp17lcG5E8I7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp17lcG5E8I7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp17lcG5E8I7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp17lcG5E8I7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp17lcG5E8I7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp17lcG5E8I7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp17lcG5E8I7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp17lcG5E8I7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp17lcG5E8I7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp17lcG5E8I7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp17lcG5E8I7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp17lcG5E8I7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp17lcG5E8I7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp17lcG5E8I7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp17lcG5E8I7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp17lcG5E8I7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp17lcG5E8I7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp17lcG5E8I7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp17lcG5E8I7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp17lcG5E8I7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp17lcG5E8I7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp17lcG5E8I7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp17lcG5E8I7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp17lcG5E8I7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp17lcG5E8I7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp17lcG5E8I7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp17lcG5E8I7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp17lcG5E8I7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp17lcG5E8I7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp17lcG5E8I7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp17lcG5E8I7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp17lcG5E8I7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp17lcG5E8I7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp17lcG5E8I7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp17lcG5E8I7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp17lcG5E8I7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp17lcG5E8I7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp17lcG5E8I7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp17lcG5E8I7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp17lcG5E8I7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp17lcG5E8I7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp17lcG5E8I7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp17lcG5E8I7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp17lcG5E8I7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp17lcG5E8I7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp17lcG5E8I7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp17lcG5E8I7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp17lcG5E8I7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp17lcG5E8I7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp17lcG5E8I7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp17lcG5E8I7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp17lcG5E8I7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp17lcG5E8I7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp17lcG5E8I7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp17lcG5E8I7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp17lcG5E8I7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Usp17lcG5E8I7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp17lcG5E8I7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp17lcG5E8I7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp17lcG5E8I7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp17lcG5E8I7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp17lcG5E8I7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp17lcG5E8I7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp17lcG5E8I7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp17lcG5E8I7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp17lcG5E8I7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp17lcG5E8I7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp17lcG5E8I7 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp17lcG5E8I7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp17lcG5E8I7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp17lcG5E8I7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp17lcG5E8I7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp17lcG5E8I7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp17lcG5E8I7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp17lcG5E8I7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp17lcG5E8I7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp17lcG5E8I7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp17lcG5E8I7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp17lcG5E8I7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp17lcG5E8I7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp17lcG5E8I7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms