Protein–RNA interactions for Protein: G5E8C1

Vmn1r67, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r67G5E8C1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r67G5E8C1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r67G5E8C1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r67G5E8C1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r67G5E8C1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r67G5E8C1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r67G5E8C1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r67G5E8C1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r67G5E8C1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r67G5E8C1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r67G5E8C1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r67G5E8C1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r67G5E8C1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r67G5E8C1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r67G5E8C1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r67G5E8C1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r67G5E8C1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r67G5E8C1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r67G5E8C1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r67G5E8C1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r67G5E8C1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r67G5E8C1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r67G5E8C1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r67G5E8C1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r67G5E8C1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r67G5E8C1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r67G5E8C1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r67G5E8C1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r67G5E8C1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r67G5E8C1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r67G5E8C1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r67G5E8C1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r67G5E8C1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r67G5E8C1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r67G5E8C1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r67G5E8C1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r67G5E8C1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r67G5E8C1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r67G5E8C1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r67G5E8C1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r67G5E8C1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r67G5E8C1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r67G5E8C1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r67G5E8C1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r67G5E8C1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r67G5E8C1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r67G5E8C1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r67G5E8C1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Vmn1r67G5E8C1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r67G5E8C1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r67G5E8C1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r67G5E8C1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r67G5E8C1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r67G5E8C1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r67G5E8C1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r67G5E8C1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r67G5E8C1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r67G5E8C1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r67G5E8C1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r67G5E8C1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r67G5E8C1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r67G5E8C1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r67G5E8C1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r67G5E8C1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r67G5E8C1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r67G5E8C1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r67G5E8C1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r67G5E8C1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r67G5E8C1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r67G5E8C1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r67G5E8C1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r67G5E8C1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r67G5E8C1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r67G5E8C1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r67G5E8C1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r67G5E8C1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r67G5E8C1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r67G5E8C1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r67G5E8C1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r67G5E8C1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r67G5E8C1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r67G5E8C1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r67G5E8C1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r67G5E8C1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r67G5E8C1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r67G5E8C1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r67G5E8C1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r67G5E8C1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r67G5E8C1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r67G5E8C1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r67G5E8C1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r67G5E8C1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r67G5E8C1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r67G5E8C1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r67G5E8C1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r67G5E8C1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r67G5E8C1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r67G5E8C1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r67G5E8C1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r67G5E8C1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms