Protein–RNA interactions for Protein: G5E829

Atp2b1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b1G5E829 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp2b1G5E829 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp2b1G5E829 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp2b1G5E829 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp2b1G5E829 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp2b1G5E829 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp2b1G5E829 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp2b1G5E829 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp2b1G5E829 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp2b1G5E829 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp2b1G5E829 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp2b1G5E829 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp2b1G5E829 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp2b1G5E829 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp2b1G5E829 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp2b1G5E829 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp2b1G5E829 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp2b1G5E829 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp2b1G5E829 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp2b1G5E829 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp2b1G5E829 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp2b1G5E829 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp2b1G5E829 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp2b1G5E829 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp2b1G5E829 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp2b1G5E829 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp2b1G5E829 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp2b1G5E829 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp2b1G5E829 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp2b1G5E829 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp2b1G5E829 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp2b1G5E829 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp2b1G5E829 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp2b1G5E829 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp2b1G5E829 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp2b1G5E829 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp2b1G5E829 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp2b1G5E829 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp2b1G5E829 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp2b1G5E829 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp2b1G5E829 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp2b1G5E829 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp2b1G5E829 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp2b1G5E829 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp2b1G5E829 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp2b1G5E829 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp2b1G5E829 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp2b1G5E829 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp2b1G5E829 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp2b1G5E829 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp2b1G5E829 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp2b1G5E829 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp2b1G5E829 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp2b1G5E829 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp2b1G5E829 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp2b1G5E829 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp2b1G5E829 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp2b1G5E829 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp2b1G5E829 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp2b1G5E829 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp2b1G5E829 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp2b1G5E829 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp2b1G5E829 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp2b1G5E829 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp2b1G5E829 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp2b1G5E829 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp2b1G5E829 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp2b1G5E829 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp2b1G5E829 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp2b1G5E829 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp2b1G5E829 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp2b1G5E829 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp2b1G5E829 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp2b1G5E829 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp2b1G5E829 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp2b1G5E829 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp2b1G5E829 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp2b1G5E829 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp2b1G5E829 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp2b1G5E829 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp2b1G5E829 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp2b1G5E829 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp2b1G5E829 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp2b1G5E829 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp2b1G5E829 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp2b1G5E829 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp2b1G5E829 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp2b1G5E829 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp2b1G5E829 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp2b1G5E829 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp2b1G5E829 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp2b1G5E829 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp2b1G5E829 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp2b1G5E829 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp2b1G5E829 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp2b1G5E829 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp2b1G5E829 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp2b1G5E829 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp2b1G5E829 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp2b1G5E829 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms