Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r58G3X9U3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r58G3X9U3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r58G3X9U3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r58G3X9U3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r58G3X9U3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r58G3X9U3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r58G3X9U3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r58G3X9U3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r58G3X9U3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r58G3X9U3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r58G3X9U3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r58G3X9U3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r58G3X9U3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r58G3X9U3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r58G3X9U3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r58G3X9U3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r58G3X9U3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r58G3X9U3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r58G3X9U3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r58G3X9U3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r58G3X9U3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r58G3X9U3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r58G3X9U3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r58G3X9U3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r58G3X9U3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r58G3X9U3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r58G3X9U3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r58G3X9U3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r58G3X9U3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r58G3X9U3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r58G3X9U3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r58G3X9U3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r58G3X9U3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r58G3X9U3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r58G3X9U3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r58G3X9U3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r58G3X9U3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r58G3X9U3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r58G3X9U3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r58G3X9U3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r58G3X9U3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r58G3X9U3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r58G3X9U3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r58G3X9U3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r58G3X9U3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r58G3X9U3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r58G3X9U3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r58G3X9U3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r58G3X9U3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r58G3X9U3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r58G3X9U3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r58G3X9U3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Vmn1r58G3X9U3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r58G3X9U3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r58G3X9U3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r58G3X9U3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r58G3X9U3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r58G3X9U3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r58G3X9U3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r58G3X9U3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r58G3X9U3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r58G3X9U3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r58G3X9U3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r58G3X9U3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r58G3X9U3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r58G3X9U3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r58G3X9U3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r58G3X9U3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r58G3X9U3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r58G3X9U3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r58G3X9U3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r58G3X9U3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r58G3X9U3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r58G3X9U3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r58G3X9U3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r58G3X9U3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r58G3X9U3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r58G3X9U3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r58G3X9U3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r58G3X9U3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r58G3X9U3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r58G3X9U3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r58G3X9U3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r58G3X9U3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r58G3X9U3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r58G3X9U3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r58G3X9U3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r58G3X9U3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r58G3X9U3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r58G3X9U3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r58G3X9U3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r58G3X9U3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r58G3X9U3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r58G3X9U3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r58G3X9U3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r58G3X9U3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r58G3X9U3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r58G3X9U3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r58G3X9U3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms