Protein–RNA interactions for Protein: G3UXB3

Nkx1-1, NK1 homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-1G3UXB3 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nkx1-1G3UXB3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nkx1-1G3UXB3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nkx1-1G3UXB3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nkx1-1G3UXB3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nkx1-1G3UXB3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nkx1-1G3UXB3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nkx1-1G3UXB3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nkx1-1G3UXB3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nkx1-1G3UXB3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nkx1-1G3UXB3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nkx1-1G3UXB3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nkx1-1G3UXB3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nkx1-1G3UXB3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nkx1-1G3UXB3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nkx1-1G3UXB3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nkx1-1G3UXB3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nkx1-1G3UXB3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nkx1-1G3UXB3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nkx1-1G3UXB3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Nkx1-1G3UXB3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nkx1-1G3UXB3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nkx1-1G3UXB3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nkx1-1G3UXB3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nkx1-1G3UXB3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nkx1-1G3UXB3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nkx1-1G3UXB3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Nkx1-1G3UXB3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nkx1-1G3UXB3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nkx1-1G3UXB3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nkx1-1G3UXB3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nkx1-1G3UXB3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nkx1-1G3UXB3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nkx1-1G3UXB3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nkx1-1G3UXB3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nkx1-1G3UXB3 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nkx1-1G3UXB3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Nkx1-1G3UXB3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nkx1-1G3UXB3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Nkx1-1G3UXB3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nkx1-1G3UXB3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nkx1-1G3UXB3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nkx1-1G3UXB3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nkx1-1G3UXB3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nkx1-1G3UXB3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nkx1-1G3UXB3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nkx1-1G3UXB3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nkx1-1G3UXB3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nkx1-1G3UXB3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nkx1-1G3UXB3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nkx1-1G3UXB3 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nkx1-1G3UXB3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Nkx1-1G3UXB3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nkx1-1G3UXB3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nkx1-1G3UXB3 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nkx1-1G3UXB3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nkx1-1G3UXB3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nkx1-1G3UXB3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nkx1-1G3UXB3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nkx1-1G3UXB3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nkx1-1G3UXB3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nkx1-1G3UXB3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nkx1-1G3UXB3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nkx1-1G3UXB3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nkx1-1G3UXB3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nkx1-1G3UXB3 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Nkx1-1G3UXB3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nkx1-1G3UXB3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nkx1-1G3UXB3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nkx1-1G3UXB3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Nkx1-1G3UXB3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nkx1-1G3UXB3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nkx1-1G3UXB3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nkx1-1G3UXB3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nkx1-1G3UXB3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nkx1-1G3UXB3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nkx1-1G3UXB3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nkx1-1G3UXB3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nkx1-1G3UXB3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nkx1-1G3UXB3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nkx1-1G3UXB3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nkx1-1G3UXB3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nkx1-1G3UXB3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nkx1-1G3UXB3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nkx1-1G3UXB3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nkx1-1G3UXB3 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Nkx1-1G3UXB3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nkx1-1G3UXB3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nkx1-1G3UXB3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nkx1-1G3UXB3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Nkx1-1G3UXB3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Nkx1-1G3UXB3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nkx1-1G3UXB3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nkx1-1G3UXB3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nkx1-1G3UXB3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Nkx1-1G3UXB3 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nkx1-1G3UXB3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nkx1-1G3UXB3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nkx1-1G3UXB3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nkx1-1G3UXB3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms