Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm28048F7BCN0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm28048F7BCN0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm28048F7BCN0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm28048F7BCN0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm28048F7BCN0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm28048F7BCN0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm28048F7BCN0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm28048F7BCN0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm28048F7BCN0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm28048F7BCN0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm28048F7BCN0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm28048F7BCN0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm28048F7BCN0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm28048F7BCN0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm28048F7BCN0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm28048F7BCN0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm28048F7BCN0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm28048F7BCN0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm28048F7BCN0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm28048F7BCN0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm28048F7BCN0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm28048F7BCN0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm28048F7BCN0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm28048F7BCN0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm28048F7BCN0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm28048F7BCN0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm28048F7BCN0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm28048F7BCN0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm28048F7BCN0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm28048F7BCN0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm28048F7BCN0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm28048F7BCN0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm28048F7BCN0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm28048F7BCN0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm28048F7BCN0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm28048F7BCN0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm28048F7BCN0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm28048F7BCN0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm28048F7BCN0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm28048F7BCN0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm28048F7BCN0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm28048F7BCN0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm28048F7BCN0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm28048F7BCN0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm28048F7BCN0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm28048F7BCN0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm28048F7BCN0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm28048F7BCN0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm28048F7BCN0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm28048F7BCN0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm28048F7BCN0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm28048F7BCN0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm28048F7BCN0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm28048F7BCN0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm28048F7BCN0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm28048F7BCN0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm28048F7BCN0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm28048F7BCN0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm28048F7BCN0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm28048F7BCN0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Gm28048F7BCN0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Gm28048F7BCN0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm28048F7BCN0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm28048F7BCN0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm28048F7BCN0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm28048F7BCN0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Gm28048F7BCN0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm28048F7BCN0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm28048F7BCN0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm28048F7BCN0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm28048F7BCN0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm28048F7BCN0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm28048F7BCN0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm28048F7BCN0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm28048F7BCN0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm28048F7BCN0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm28048F7BCN0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm28048F7BCN0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm28048F7BCN0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm28048F7BCN0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm28048F7BCN0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm28048F7BCN0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm28048F7BCN0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm28048F7BCN0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm28048F7BCN0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm28048F7BCN0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm28048F7BCN0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm28048F7BCN0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm28048F7BCN0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm28048F7BCN0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm28048F7BCN0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm28048F7BCN0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm28048F7BCN0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm28048F7BCN0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm28048F7BCN0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm28048F7BCN0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm28048F7BCN0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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