Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm340F6RGI3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gm340F6RGI3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gm340F6RGI3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gm340F6RGI3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm340F6RGI3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm340F6RGI3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm340F6RGI3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm340F6RGI3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm340F6RGI3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm340F6RGI3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm340F6RGI3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm340F6RGI3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm340F6RGI3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm340F6RGI3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm340F6RGI3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm340F6RGI3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm340F6RGI3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm340F6RGI3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm340F6RGI3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm340F6RGI3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm340F6RGI3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm340F6RGI3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm340F6RGI3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm340F6RGI3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm340F6RGI3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm340F6RGI3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm340F6RGI3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm340F6RGI3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm340F6RGI3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm340F6RGI3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm340F6RGI3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm340F6RGI3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm340F6RGI3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm340F6RGI3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm340F6RGI3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm340F6RGI3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm340F6RGI3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm340F6RGI3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm340F6RGI3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm340F6RGI3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm340F6RGI3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm340F6RGI3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm340F6RGI3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm340F6RGI3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm340F6RGI3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm340F6RGI3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm340F6RGI3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm340F6RGI3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm340F6RGI3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm340F6RGI3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm340F6RGI3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm340F6RGI3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm340F6RGI3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm340F6RGI3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm340F6RGI3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm340F6RGI3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm340F6RGI3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm340F6RGI3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm340F6RGI3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm340F6RGI3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm340F6RGI3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm340F6RGI3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm340F6RGI3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm340F6RGI3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm340F6RGI3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm340F6RGI3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm340F6RGI3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm340F6RGI3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm340F6RGI3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm340F6RGI3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm340F6RGI3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm340F6RGI3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm340F6RGI3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm340F6RGI3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm340F6RGI3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm340F6RGI3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm340F6RGI3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm340F6RGI3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm340F6RGI3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm340F6RGI3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm340F6RGI3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm340F6RGI3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm340F6RGI3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm340F6RGI3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm340F6RGI3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm340F6RGI3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm340F6RGI3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm340F6RGI3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm340F6RGI3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm340F6RGI3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm340F6RGI3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm340F6RGI3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm340F6RGI3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm340F6RGI3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm340F6RGI3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm340F6RGI3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm340F6RGI3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm340F6RGI3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm340F6RGI3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms