Protein–RNA interactions for Protein: F6R3P9

Prl3d2, Growth hormone d5, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prl3d2F6R3P9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prl3d2F6R3P9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prl3d2F6R3P9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prl3d2F6R3P9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Prl3d2F6R3P9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Prl3d2F6R3P9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Prl3d2F6R3P9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prl3d2F6R3P9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prl3d2F6R3P9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prl3d2F6R3P9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prl3d2F6R3P9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prl3d2F6R3P9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prl3d2F6R3P9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prl3d2F6R3P9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prl3d2F6R3P9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Prl3d2F6R3P9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prl3d2F6R3P9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prl3d2F6R3P9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prl3d2F6R3P9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prl3d2F6R3P9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prl3d2F6R3P9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prl3d2F6R3P9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prl3d2F6R3P9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prl3d2F6R3P9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prl3d2F6R3P9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prl3d2F6R3P9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prl3d2F6R3P9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prl3d2F6R3P9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prl3d2F6R3P9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prl3d2F6R3P9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prl3d2F6R3P9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prl3d2F6R3P9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prl3d2F6R3P9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prl3d2F6R3P9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prl3d2F6R3P9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prl3d2F6R3P9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Prl3d2F6R3P9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prl3d2F6R3P9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prl3d2F6R3P9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Prl3d2F6R3P9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Prl3d2F6R3P9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prl3d2F6R3P9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prl3d2F6R3P9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prl3d2F6R3P9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prl3d2F6R3P9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Prl3d2F6R3P9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prl3d2F6R3P9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prl3d2F6R3P9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Prl3d2F6R3P9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prl3d2F6R3P9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prl3d2F6R3P9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prl3d2F6R3P9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prl3d2F6R3P9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Prl3d2F6R3P9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prl3d2F6R3P9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prl3d2F6R3P9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Prl3d2F6R3P9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prl3d2F6R3P9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prl3d2F6R3P9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Prl3d2F6R3P9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Prl3d2F6R3P9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prl3d2F6R3P9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prl3d2F6R3P9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prl3d2F6R3P9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prl3d2F6R3P9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prl3d2F6R3P9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prl3d2F6R3P9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prl3d2F6R3P9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prl3d2F6R3P9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prl3d2F6R3P9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prl3d2F6R3P9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prl3d2F6R3P9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prl3d2F6R3P9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prl3d2F6R3P9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prl3d2F6R3P9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prl3d2F6R3P9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prl3d2F6R3P9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prl3d2F6R3P9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prl3d2F6R3P9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prl3d2F6R3P9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prl3d2F6R3P9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prl3d2F6R3P9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prl3d2F6R3P9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prl3d2F6R3P9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prl3d2F6R3P9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prl3d2F6R3P9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prl3d2F6R3P9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prl3d2F6R3P9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prl3d2F6R3P9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prl3d2F6R3P9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prl3d2F6R3P9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prl3d2F6R3P9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prl3d2F6R3P9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prl3d2F6R3P9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prl3d2F6R3P9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prl3d2F6R3P9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prl3d2F6R3P9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Prl3d2F6R3P9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prl3d2F6R3P9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prl3d2F6R3P9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms