Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U0

Usp17lb, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein B, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lbE9Q9U0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp17lbE9Q9U0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp17lbE9Q9U0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp17lbE9Q9U0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp17lbE9Q9U0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp17lbE9Q9U0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp17lbE9Q9U0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp17lbE9Q9U0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp17lbE9Q9U0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp17lbE9Q9U0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp17lbE9Q9U0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp17lbE9Q9U0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp17lbE9Q9U0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp17lbE9Q9U0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp17lbE9Q9U0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp17lbE9Q9U0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp17lbE9Q9U0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp17lbE9Q9U0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp17lbE9Q9U0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp17lbE9Q9U0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp17lbE9Q9U0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp17lbE9Q9U0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp17lbE9Q9U0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp17lbE9Q9U0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp17lbE9Q9U0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp17lbE9Q9U0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp17lbE9Q9U0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp17lbE9Q9U0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp17lbE9Q9U0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp17lbE9Q9U0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp17lbE9Q9U0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp17lbE9Q9U0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp17lbE9Q9U0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp17lbE9Q9U0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp17lbE9Q9U0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp17lbE9Q9U0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp17lbE9Q9U0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp17lbE9Q9U0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp17lbE9Q9U0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp17lbE9Q9U0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp17lbE9Q9U0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp17lbE9Q9U0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp17lbE9Q9U0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp17lbE9Q9U0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp17lbE9Q9U0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Usp17lbE9Q9U0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Usp17lbE9Q9U0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp17lbE9Q9U0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp17lbE9Q9U0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp17lbE9Q9U0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp17lbE9Q9U0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp17lbE9Q9U0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp17lbE9Q9U0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp17lbE9Q9U0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp17lbE9Q9U0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp17lbE9Q9U0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp17lbE9Q9U0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp17lbE9Q9U0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp17lbE9Q9U0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp17lbE9Q9U0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp17lbE9Q9U0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp17lbE9Q9U0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp17lbE9Q9U0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp17lbE9Q9U0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp17lbE9Q9U0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp17lbE9Q9U0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp17lbE9Q9U0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp17lbE9Q9U0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp17lbE9Q9U0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp17lbE9Q9U0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp17lbE9Q9U0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp17lbE9Q9U0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp17lbE9Q9U0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp17lbE9Q9U0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp17lbE9Q9U0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp17lbE9Q9U0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp17lbE9Q9U0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp17lbE9Q9U0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp17lbE9Q9U0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp17lbE9Q9U0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp17lbE9Q9U0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp17lbE9Q9U0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp17lbE9Q9U0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp17lbE9Q9U0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp17lbE9Q9U0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp17lbE9Q9U0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp17lbE9Q9U0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp17lbE9Q9U0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp17lbE9Q9U0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp17lbE9Q9U0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp17lbE9Q9U0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp17lbE9Q9U0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp17lbE9Q9U0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp17lbE9Q9U0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp17lbE9Q9U0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp17lbE9Q9U0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp17lbE9Q9U0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp17lbE9Q9U0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp17lbE9Q9U0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp17lbE9Q9U0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms