Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
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