Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Zfp558E9Q1J0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Zfp558E9Q1J0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Zfp558E9Q1J0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Zfp558E9Q1J0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Zfp558E9Q1J0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Zfp558E9Q1J0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Zfp558E9Q1J0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Zfp558E9Q1J0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Zfp558E9Q1J0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Zfp558E9Q1J0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Zfp558E9Q1J0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Zfp558E9Q1J0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Zfp558E9Q1J0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Zfp558E9Q1J0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Zfp558E9Q1J0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Zfp558E9Q1J0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Zfp558E9Q1J0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Zfp558E9Q1J0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Zfp558E9Q1J0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Zfp558E9Q1J0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Zfp558E9Q1J0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Zfp558E9Q1J0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Zfp558E9Q1J0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Zfp558E9Q1J0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Zfp558E9Q1J0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Zfp558E9Q1J0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Zfp558E9Q1J0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Zfp558E9Q1J0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Zfp558E9Q1J0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Zfp558E9Q1J0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Zfp558E9Q1J0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Zfp558E9Q1J0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Zfp558E9Q1J0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Zfp558E9Q1J0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Zfp558E9Q1J0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Zfp558E9Q1J0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Zfp558E9Q1J0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Zfp558E9Q1J0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Zfp558E9Q1J0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Zfp558E9Q1J0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Zfp558E9Q1J0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Zfp558E9Q1J0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Zfp558E9Q1J0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Zfp558E9Q1J0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Zfp558E9Q1J0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Zfp558E9Q1J0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Zfp558E9Q1J0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Zfp558E9Q1J0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Zfp558E9Q1J0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Zfp558E9Q1J0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Zfp558E9Q1J0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Zfp558E9Q1J0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Zfp558E9Q1J0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Zfp558E9Q1J0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Zfp558E9Q1J0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Zfp558E9Q1J0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Zfp558E9Q1J0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Zfp558E9Q1J0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Zfp558E9Q1J0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Zfp558E9Q1J0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Zfp558E9Q1J0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Zfp558E9Q1J0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Zfp558E9Q1J0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Zfp558E9Q1J0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Zfp558E9Q1J0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Zfp558E9Q1J0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Zfp558E9Q1J0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Zfp558E9Q1J0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Zfp558E9Q1J0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Zfp558E9Q1J0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zfp558E9Q1J0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zfp558E9Q1J0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zfp558E9Q1J0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Zfp558E9Q1J0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zfp558E9Q1J0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zfp558E9Q1J0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zfp558E9Q1J0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zfp558E9Q1J0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zfp558E9Q1J0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zfp558E9Q1J0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zfp558E9Q1J0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zfp558E9Q1J0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zfp558E9Q1J0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zfp558E9Q1J0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zfp558E9Q1J0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zfp558E9Q1J0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zfp558E9Q1J0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zfp558E9Q1J0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zfp558E9Q1J0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zfp558E9Q1J0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zfp558E9Q1J0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zfp558E9Q1J0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zfp558E9Q1J0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zfp558E9Q1J0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zfp558E9Q1J0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zfp558E9Q1J0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zfp558E9Q1J0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zfp558E9Q1J0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zfp558E9Q1J0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms