Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B4

Cdr1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr1E9Q0B4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdr1E9Q0B4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdr1E9Q0B4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdr1E9Q0B4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdr1E9Q0B4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdr1E9Q0B4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdr1E9Q0B4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdr1E9Q0B4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdr1E9Q0B4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdr1E9Q0B4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdr1E9Q0B4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdr1E9Q0B4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdr1E9Q0B4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdr1E9Q0B4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdr1E9Q0B4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdr1E9Q0B4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdr1E9Q0B4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdr1E9Q0B4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdr1E9Q0B4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cdr1E9Q0B4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cdr1E9Q0B4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cdr1E9Q0B4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdr1E9Q0B4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdr1E9Q0B4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdr1E9Q0B4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdr1E9Q0B4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdr1E9Q0B4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdr1E9Q0B4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdr1E9Q0B4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdr1E9Q0B4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdr1E9Q0B4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdr1E9Q0B4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdr1E9Q0B4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cdr1E9Q0B4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Cdr1E9Q0B4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cdr1E9Q0B4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cdr1E9Q0B4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cdr1E9Q0B4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdr1E9Q0B4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdr1E9Q0B4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdr1E9Q0B4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdr1E9Q0B4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdr1E9Q0B4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdr1E9Q0B4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdr1E9Q0B4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdr1E9Q0B4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdr1E9Q0B4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdr1E9Q0B4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdr1E9Q0B4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdr1E9Q0B4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdr1E9Q0B4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdr1E9Q0B4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdr1E9Q0B4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdr1E9Q0B4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdr1E9Q0B4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdr1E9Q0B4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdr1E9Q0B4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdr1E9Q0B4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdr1E9Q0B4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdr1E9Q0B4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdr1E9Q0B4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdr1E9Q0B4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdr1E9Q0B4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdr1E9Q0B4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdr1E9Q0B4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdr1E9Q0B4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdr1E9Q0B4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdr1E9Q0B4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdr1E9Q0B4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdr1E9Q0B4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdr1E9Q0B4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdr1E9Q0B4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdr1E9Q0B4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdr1E9Q0B4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdr1E9Q0B4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdr1E9Q0B4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdr1E9Q0B4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdr1E9Q0B4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdr1E9Q0B4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdr1E9Q0B4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdr1E9Q0B4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdr1E9Q0B4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cdr1E9Q0B4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cdr1E9Q0B4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cdr1E9Q0B4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cdr1E9Q0B4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cdr1E9Q0B4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cdr1E9Q0B4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cdr1E9Q0B4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cdr1E9Q0B4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cdr1E9Q0B4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cdr1E9Q0B4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cdr1E9Q0B4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cdr1E9Q0B4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cdr1E9Q0B4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cdr1E9Q0B4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cdr1E9Q0B4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cdr1E9Q0B4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Cdr1E9Q0B4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cdr1E9Q0B4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms