Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
Fndc1E9Q043 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Fndc1E9Q043 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Fndc1E9Q043 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Fndc1E9Q043 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Fndc1E9Q043 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Fndc1E9Q043 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Fndc1E9Q043 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Fndc1E9Q043 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Fndc1E9Q043 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Fndc1E9Q043 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Fndc1E9Q043 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Fndc1E9Q043 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Fndc1E9Q043 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Fndc1E9Q043 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
Fndc1E9Q043 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.7■■■□□ 2.51
Fndc1E9Q043 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Fndc1E9Q043 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.5
Fndc1E9Q043 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Fndc1E9Q043 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Fndc1E9Q043 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Fndc1E9Q043 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Fndc1E9Q043 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Fndc1E9Q043 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Fndc1E9Q043 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Fndc1E9Q043 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Fndc1E9Q043 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Fndc1E9Q043 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Fndc1E9Q043 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Fndc1E9Q043 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Fndc1E9Q043 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Fndc1E9Q043 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Fndc1E9Q043 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Fndc1E9Q043 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Fndc1E9Q043 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Fndc1E9Q043 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
Fndc1E9Q043 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Fndc1E9Q043 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Fndc1E9Q043 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Fndc1E9Q043 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Fndc1E9Q043 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Fndc1E9Q043 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Fndc1E9Q043 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
Fndc1E9Q043 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Fndc1E9Q043 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
Fndc1E9Q043 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Fndc1E9Q043 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Fndc1E9Q043 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Fndc1E9Q043 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Fndc1E9Q043 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Fndc1E9Q043 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Fndc1E9Q043 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Fndc1E9Q043 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Fndc1E9Q043 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Fndc1E9Q043 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
Fndc1E9Q043 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Fndc1E9Q043 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Fndc1E9Q043 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Fndc1E9Q043 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Fndc1E9Q043 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Fndc1E9Q043 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Fndc1E9Q043 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Fndc1E9Q043 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Fndc1E9Q043 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Fndc1E9Q043 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Fndc1E9Q043 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Fndc1E9Q043 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Fndc1E9Q043 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Fndc1E9Q043 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Fndc1E9Q043 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
Fndc1E9Q043 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Fndc1E9Q043 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
Fndc1E9Q043 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Fndc1E9Q043 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Fndc1E9Q043 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Fndc1E9Q043 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Fndc1E9Q043 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
Fndc1E9Q043 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Fndc1E9Q043 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Fndc1E9Q043 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Fndc1E9Q043 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Fndc1E9Q043 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Fndc1E9Q043 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Fndc1E9Q043 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Fndc1E9Q043 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
Fndc1E9Q043 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Fndc1E9Q043 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Fndc1E9Q043 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
Fndc1E9Q043 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Fndc1E9Q043 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Fndc1E9Q043 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Fndc1E9Q043 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Fndc1E9Q043 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Fndc1E9Q043 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Fndc1E9Q043 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Fndc1E9Q043 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Fndc1E9Q043 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Fndc1E9Q043 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Fndc1E9Q043 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Fndc1E9Q043 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms